Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3C5Y


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 85 ligands in PDB entry 3C5Y. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
CSD
A
72 83-SULFINOALANINE
lig 2
CSD
B
72 83-SULFINOALANINE
lig 3
CSD
C
72 83-SULFINOALANINE
lig 4
CSD
D
72 83-SULFINOALANINE
lig 5
CSD
E
72 83-SULFINOALANINE
lig 6
CSD
F
72 83-SULFINOALANINE
lig 7
CSD
G
72 83-SULFINOALANINE
lig 8
CSD
H
72 83-SULFINOALANINE
lig 9
CSD
I
72 83-SULFINOALANINE
lig 10
CSD
J
72 83-SULFINOALANINE
lig 11
CSD
K
72 83-SULFINOALANINE
lig 12
CSD
L
72 83-SULFINOALANINE
lig 13
CSD
M
72 83-SULFINOALANINE
lig 14
CSD
N
72 83-SULFINOALANINE
lig 15
CSD
O
72 83-SULFINOALANINE
lig 16
CSD
P
72 83-SULFINOALANINE
lig 17
EDO
A
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
215 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
216 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
217 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
A
218 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
A
219 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
220 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
B
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
B
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
B
215 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
B
216 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
B
217 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
B
218 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
C
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
C
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
D
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
D
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
E
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
E
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
E
215 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
E
216 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
E
217 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
NO3
F
213 4NITRATE ION
lig 41
NO3
F
214 4NITRATE ION
lig 42
NO3
F
215 4NITRATE ION
lig 43
NO3
F
216 4NITRATE ION
lig 44
EDO
F
217 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
F
218 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
F
219 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
F
220 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
F
221 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
F
222 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
NO3
G
213 4NITRATE ION
lig 51
NO3
G
214 4NITRATE ION
lig 52
EDO
G
215 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
G
216 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
G
217 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
EDO
G
218 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
EDO
G
219 41,2-ETHANEDIOL
lig 57
EDO
G
220 41,2-ETHANEDIOL
lig 58
EDO
G
221 41,2-ETHANEDIOL
lig 59
EDO
H
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 60
EDO
H
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 61
EDO
H
215 41,2-ETHANEDIOL
lig 62
EDO
H
216 41,2-ETHANEDIOL
lig 63
EDO
H
217 41,2-ETHANEDIOL
lig 64
EDO
H
218 41,2-ETHANEDIOL
lig 65
NO3
I
213 4NITRATE ION
lig 66
EDO
I
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 67
EDO
I
215 41,2-ETHANEDIOL
lig 68
EDO
I
216 41,2-ETHANEDIOL
lig 69
EDO
I
217 41,2-ETHANEDIOL
lig 70
EDO
J
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 71
EDO
J
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 72
EDO
J
215 41,2-ETHANEDIOL
lig 73
EDO
K
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 74
EDO
K
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 75
EDO
K
215 41,2-ETHANEDIOL
lig 76
EDO
L
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 77
EDO
M
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 78
EDO
M
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 79
EDO
M
215 41,2-ETHANEDIOL
lig 80
EDO
M
216 41,2-ETHANEDIOL
lig 81
EDO
N
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 82
EDO
N
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 83
EDO
N
215 41,2-ETHANEDIOL
lig 84
NO3
P
213 4NITRATE ION
lig 85
EDO
P
214 41,2-ETHANEDIOL