Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3DTD


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 18 ligands in PDB entry 3DTD. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
GOL
B
1 6GLYCEROL
lig 2
GOL
B
194 6GLYCEROL
lig 3
GOL
C
1 6GLYCEROL
lig 4
GOL
C
194 6GLYCEROL
lig 5
GOL
C
195 6GLYCEROL
lig 6
GOL
C
196 6GLYCEROL
lig 7
GOL
D
1 6GLYCEROL
lig 8
GOL
F
1 6GLYCEROL
lig 9
GOL
G
1 6GLYCEROL
lig 10
GOL
H
1 6GLYCEROL
lig 11
GOL
H
194 6GLYCEROL
lig 12
GOL
I
1 6GLYCEROL
lig 13
GOL
I
194 6GLYCEROL
lig 14
GOL
I
195 6GLYCEROL
lig 15
GOL
J
1 6GLYCEROL
lig 16
GOL
K
1 6GLYCEROL
lig 17
GOL
L
1 6GLYCEROL
lig 18
GOL
L
194 6GLYCEROL