Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3Q3G


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 49 ligands in PDB entry 3Q3G. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
EDO
C
609 41,2-ETHANEDIOL
lig 2
EDO
C
628 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
GOL
C
710 6GLYCEROL
lig 4
EDO
D
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
D
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
D
613 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
D
614 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
D
619 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
GOL
D
702 6GLYCEROL
lig 10
GOL
D
705 6GLYCEROL
lig 11
GOL
D
708 6GLYCEROL
lig 12
NA
D
800 1SODIUM ION
lig 13
CA
G
500 1CALCIUM ION
lig 14
EDO
G
620 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
GOL
G
703 6GLYCEROL
lig 16
CL
G
907 1CHLORIDE ION
lig 17
EDO
F
621 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
618 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
625 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
GOL
A
700 6GLYCEROL
lig 21
EDO
B
606 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
B
607 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
B
616 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
B
624 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
GOL
B
701 6GLYCEROL
lig 26
GOL
B
704 6GLYCEROL
lig 27
CA
E
500 1CALCIUM ION
lig 28
EDO
E
600 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
E
627 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
CL
E
902 1CHLORIDE ION
lig 31
CL
E
906 1CHLORIDE ION
lig 32
NA
H
801 1SODIUM ION
lig 33
NA
H
802 1SODIUM ION
lig 34
PEG
H
1000 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 35
CA
I
500 1CALCIUM ION
lig 36
EDO
J
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
J
622 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
GOL
J
709 6GLYCEROL
lig 39
CL
J
903 1CHLORIDE ION
lig 40
EDO
K
601 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
K
608 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
K
611 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
K
612 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
GOL
K
706 6GLYCEROL
lig 45
GOL
K
707 6GLYCEROL
lig 46
CL
K
904 1CHLORIDE ION
lig 47
CA
L
500 1CALCIUM ION
lig 48
EDO
L
610 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
L
615 41,2-ETHANEDIOL