Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
6MBJ


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 42 ligands in PDB entry 6MBJ. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
EDO
Y
101 41,2-ETHANEDIOL
lig 2
SAH
A
601 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 3
EDO
A
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
606 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
607 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
608 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
609 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
610 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
611 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
612 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
613 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
614 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
615 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
616 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
617 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
618 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
619 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
GOL
A
620 6GLYCEROL
lig 22
GOL
A
621 6GLYCEROL
lig 23
GOL
A
622 6GLYCEROL
lig 24
ACT
A
623 4ACETATE ION
lig 25
ACT
A
624 4ACETATE ION
lig 26
SAH
B
1001 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 27
EDO
B
1002 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
B
1003 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
B
1004 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
B
1005 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
B
1006 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
B
1007 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
B
1008 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
B
1009 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
B
1010 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
B
1011 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
B
1012 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
B
1013 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
B
1014 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
B
1015 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
B
1016 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
B
1017 41,2-ETHANEDIOL