3JB9 | Rna Binding Protein Rna | date | Aug 09, 2015 |
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title | Cryo-Em Structure Of The Yeast Spliceosome At 3.6 Angstrom R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
authors | C.Yan, J.Hang, R.Wan, M.Huang, C.Wong, Y.Shi | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
compound | source | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Spp42 Chain: A Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 6 |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Cwf10 Chain: B Synonym: 114 Kda U5 Small Nuclear Ribonucleoprotein Compone Homolog, Complexed With Cdc5 Protein 10; |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: U5 Snrna Chain: C |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 4896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Small Nuclear Ribonucleoprotein Sm D3 Chain: D, Z Synonym: Sm-D3, Snrnp Core Protein D3 |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Small Nuclear Ribonucleoprotein-Associated Protei Chain: E, b Synonym: Snrnp-B, Sm Protein B, Sm-B, Smb |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Small Nuclear Ribonucleoprotein Sm D1 Chain: F, f Synonym: Sm-D1, Snrnp Core Protein D1 |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Small Nuclear Ribonucleoprotein Sm D2 Chain: G, l Synonym: Sm-D2, Complexed With Cdc5 Protein 9, Snrnp Core P |
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Molecule: Small Nuclear Ribonucleoprotein E Chain: H, m Synonym: Snrnp-E, Sm Protein E, Sm-E, Sme |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Small Nuclear Ribonucleoprotein F Chain: I, n Synonym: Snrnp-F, Sm Protein F, Sm-F, Smf |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Small Nuclear Ribonucleoprotein G Chain: J, o Synonym: Snrnp-G, Sm Protein G, Sm-G, Smg |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Prp5 Chain: K Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 1, Pre-Mrna-Processing 5; |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Cwf17 Chain: L Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 17 |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Processing Protein 45 Chain: M Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 13, Transcriptional Co Snw1; |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: U6 Snrna Chain: N |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 4896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Rna (5'-R(Pgpupapupgpupapu)-3') Chain: O |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 4896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Rna (5'-R(Pupupupapupapcpupapapcpapc Chain: Q Other_details: Chain O And Q Come From One Rna Molecule. At (Q 501) Is Covalently Binding To Atom P G (Q 100).; |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 4896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: U2 Snrna Chain: P |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 4896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Processing Factor 19 Chain: S, T, U, V Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 8 Ec: 6.3.2.- |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Cdc5 Chain: W Synonym: Cell Division Control Protein 5 |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Cwf2 Chain: Y Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 2, Pre-Mrna-Processing 3; |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Cwf5 Chain: a Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 5 |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Cwf19 Chain: c Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 19 |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase Ppi1 Chain: d Synonym: Ppiase Ppi1, Cyclophilin Ppi1, Rotamase Ppi1 Ec: 5.2.1.8 |
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Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Cwf14 Chain: e Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 14 |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Processing Factor 17 Chain: g |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Cwf15 Chain: h Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 15 |
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Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Cwf7 Chain: I Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 7, Splicing Factor 27 |
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Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Cwf4 Chain: R Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 4 |
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Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Cwf3 Chain: r Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 3 |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Pre-Mrna-Splicing Factor Cwf11 Chain: X Synonym: Complexed With Cdc5 Protein 11 |
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Molecule: U2 Small Nuclear Ribonucleoprotein A' Chain: j Synonym: U2 Snrnp A' |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Probable U2 Small Nuclear Ribonucleoprotein B'' Chain: k Synonym: U2 Snrnp B'' |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule: Unknown Chain Chain: x |
Organism_scientific: Schizosaccharomyces Pombe 972h- Organism_common: Fission Yeast Organism_taxid: 284812 Strain: 972 Atcc 24843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
symmetry | Space Group: P 1 |
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crystal cell |
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method | Electron Microscopy | resolution | 3.60 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ligand | ADP, GDP, MG, ZN | enzyme | Ligase E.C.6.3.2 BRENDA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology |
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OCA© by Jaime Prilusky, 1996-2014,2022 Bioinformatics Unit Weizmann Institute of Science |