Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
1NF4


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 96 ligands in PDB entry 1NF4. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
FE2
A
200 1FE (II) ION
lig 2
FE2
A
201 1FE (II) ION
lig 3
SO4
A
1001 5SULFATE ION
lig 4
SO4
A
1003 5SULFATE ION
lig 5
SO4
A
1006 5SULFATE ION
lig 6
FEC
A
1007 49 ACID FERROUS COMPLEX
lig 7
SO4
B
1005 5SULFATE ION
lig 8
FE2
B
200 1FE (II) ION
lig 9
FE2
B
201 1FE (II) ION
lig 10
SO4
B
1101 5SULFATE ION
lig 11
SO4
B
1103 5SULFATE ION
lig 12
SO4
B
1104 5SULFATE ION
lig 13
SO4
B
1106 5SULFATE ION
lig 14
FE2
C
200 1FE (II) ION
lig 15
FE2
C
201 1FE (II) ION
lig 16
SO4
C
1201 5SULFATE ION
lig 17
SO4
C
1203 5SULFATE ION
lig 18
SO4
C
1204 5SULFATE ION
lig 19
SO4
C
1206 5SULFATE ION
lig 20
FEC
C
1207 49 ACID FERROUS COMPLEX
lig 21
FE2
D
200 1FE (II) ION
lig 22
FE2
D
201 1FE (II) ION
lig 23
SO4
D
1301 5SULFATE ION
lig 24
SO4
D
1303 5SULFATE ION
lig 25
SO4
D
1306 5SULFATE ION
lig 26
SO4
E
1304 5SULFATE ION
lig 27
FE2
E
200 1FE (II) ION
lig 28
FE2
E
201 1FE (II) ION
lig 29
SO4
E
1403 5SULFATE ION
lig 30
SO4
E
1406 5SULFATE ION
lig 31
FEC
E
1407 49 ACID FERROUS COMPLEX
lig 32
FE2
F
200 1FE (II) ION
lig 33
FE2
F
201 1FE (II) ION
lig 34
SO4
F
1501 5SULFATE ION
lig 35
SO4
F
1502 5SULFATE ION
lig 36
SO4
F
1506 5SULFATE ION
lig 37
FE2
G
200 1FE (II) ION
lig 38
FE2
G
201 1FE (II) ION
lig 39
SO4
G
1601 5SULFATE ION
lig 40
SO4
G
1603 5SULFATE ION
lig 41
SO4
G
1606 5SULFATE ION
lig 42
FEC
G
1607 49 ACID FERROUS COMPLEX
lig 43
FE2
H
200 1FE (II) ION
lig 44
FE2
H
201 1FE (II) ION
lig 45
SO4
H
1701 5SULFATE ION
lig 46
SO4
H
1702 5SULFATE ION
lig 47
SO4
H
1703 5SULFATE ION
lig 48
SO4
H
1706 5SULFATE ION
lig 49
SO4
I
1704 5SULFATE ION
lig 50
FE2
I
200 1FE (II) ION
lig 51
FE2
I
201 1FE (II) ION
lig 52
SO4
I
1801 5SULFATE ION
lig 53
SO4
I
1802 5SULFATE ION
lig 54
SO4
I
1803 5SULFATE ION
lig 55
SO4
I
1804 5SULFATE ION
lig 56
FEC
I
1805 49 ACID FERROUS COMPLEX
lig 57
FE2
J
200 1FE (II) ION
lig 58
FE2
J
201 1FE (II) ION
lig 59
SO4
J
1901 5SULFATE ION
lig 60
SO4
J
1904 5SULFATE ION
lig 61
SO4
J
1906 5SULFATE ION
lig 62
FE2
K
200 1FE (II) ION
lig 63
FE2
K
201 1FE (II) ION
lig 64
SO4
K
2001 5SULFATE ION
lig 65
SO4
K
2003 5SULFATE ION
lig 66
SO4
K
2006 5SULFATE ION
lig 67
FE2
L
200 1FE (II) ION
lig 68
FE2
L
201 1FE (II) ION
lig 69
SO4
L
2101 5SULFATE ION
lig 70
SO4
L
2102 5SULFATE ION
lig 71
SO4
L
2104 5SULFATE ION
lig 72
SO4
L
2106 5SULFATE ION
lig 73
FEC
L
2107 49 ACID FERROUS COMPLEX
lig 74
FE2
M
200 1FE (II) ION
lig 75
FE2
M
201 1FE (II) ION
lig 76
SO4
M
2201 5SULFATE ION
lig 77
SO4
M
2202 5SULFATE ION
lig 78
SO4
M
2203 5SULFATE ION
lig 79
SO4
M
2206 5SULFATE ION
lig 80
FEC
M
2207 49 ACID FERROUS COMPLEX
lig 81
FE2
N
200 1FE (II) ION
lig 82
FE2
N
201 1FE (II) ION
lig 83
SO4
N
2301 5SULFATE ION
lig 84
SO4
N
2303 5SULFATE ION
lig 85
SO4
N
2306 5SULFATE ION
lig 86
FE2
O
200 1FE (II) ION
lig 87
FE2
O
201 1FE (II) ION
lig 88
SO4
O
2403 5SULFATE ION
lig 89
SO4
O
2406 5SULFATE ION
lig 90
SO4
P
1504 5SULFATE ION
lig 91
FE2
P
200 1FE (II) ION
lig 92
FE2
P
201 1FE (II) ION
lig 93
SO4
P
2501 5SULFATE ION
lig 94
SO4
P
2503 5SULFATE ION
lig 95
SO4
P
2506 5SULFATE ION
lig 96
FEC
P
2507 49 ACID FERROUS COMPLEX