Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
1NXD


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 53 ligands in PDB entry 1NXD. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
AZI
1
907 3AZIDE ION
lig 2
AZI
1
910 3AZIDE ION
lig 3
AZI
1
912 3AZIDE ION
lig 4
MN
1
1001 1MANGANESE (II) ION
lig 5
MN
1
1002 1MANGANESE (II) ION
lig 6
NA
1
1012 1SODIUM ION
lig 7
GOL
1
804 6GLYCEROL
lig 8
GOL
1
806 6GLYCEROL
lig 9
GOL
1
807 6GLYCEROL
lig 10
GOL
1
812 6GLYCEROL
lig 11
GOL
1
821 6GLYCEROL
lig 12
GOL
1
822 6GLYCEROL
lig 13
GOL
1
823 6GLYCEROL
lig 14
GOL
1
824 6GLYCEROL
lig 15
AZI
2
902 3AZIDE ION
lig 16
AZI
2
905 3AZIDE ION
lig 17
AZI
2
908 3AZIDE ION
lig 18
AZI
2
913 3AZIDE ION
lig 19
AZI
2
915 3AZIDE ION
lig 20
MN
2
1003 1MANGANESE (II) ION
lig 21
MN
2
1004 1MANGANESE (II) ION
lig 22
NA
2
1009 1SODIUM ION
lig 23
GOL
2
809 6GLYCEROL
lig 24
GOL
2
811 6GLYCEROL
lig 25
GOL
2
814 6GLYCEROL
lig 26
GOL
2
815 6GLYCEROL
lig 27
GOL
2
818 6GLYCEROL
lig 28
GOL
2
820 6GLYCEROL
lig 29
AZI
3
901 3AZIDE ION
lig 30
AZI
3
904 3AZIDE ION
lig 31
AZI
3
909 3AZIDE ION
lig 32
AZI
3
914 3AZIDE ION
lig 33
MN
3
1005 1MANGANESE (II) ION
lig 34
MN
3
1006 1MANGANESE (II) ION
lig 35
NA
3
1011 1SODIUM ION
lig 36
GOL
3
802 6GLYCEROL
lig 37
GOL
3
803 6GLYCEROL
lig 38
GOL
3
808 6GLYCEROL
lig 39
GOL
3
816 6GLYCEROL
lig 40
GOL
3
825 6GLYCEROL
lig 41
AZI
4
903 3AZIDE ION
lig 42
AZI
4
906 3AZIDE ION
lig 43
AZI
4
911 3AZIDE ION
lig 44
AZI
4
916 3AZIDE ION
lig 45
MN
4
1007 1MANGANESE (II) ION
lig 46
MN
4
1008 1MANGANESE (II) ION
lig 47
NA
4
1010 1SODIUM ION
lig 48
GOL
4
801 6GLYCEROL
lig 49
GOL
4
805 6GLYCEROL
lig 50
GOL
4
810 6GLYCEROL
lig 51
GOL
4
813 6GLYCEROL
lig 52
GOL
4
817 6GLYCEROL
lig 53
GOL
4
819 6GLYCEROL