Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
1Q8F


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 20 ligands in PDB entry 1Q8F. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
CA
A
2001 1CALCIUM ION
lig 2
GOL
A
3001 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
3005 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
3009 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
3010 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
3015 6GLYCEROL
lig 7
CA
B
2002 1CALCIUM ION
lig 8
GOL
B
3002 6GLYCEROL
lig 9
GOL
B
3006 6GLYCEROL
lig 10
GOL
B
3011 6GLYCEROL
lig 11
CA
C
2003 1CALCIUM ION
lig 12
GOL
C
3003 6GLYCEROL
lig 13
GOL
C
3007 6GLYCEROL
lig 14
GOL
C
3012 6GLYCEROL
lig 15
GOL
C
3016 6GLYCEROL
lig 16
CA
D
2004 1CALCIUM ION
lig 17
GOL
D
3004 6GLYCEROL
lig 18
GOL
D
3008 6GLYCEROL
lig 19
GOL
D
3014 6GLYCEROL
lig 20
GOL
D
3017 6GLYCEROL