Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
1RVV


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 60 ligands in PDB entry 1RVV. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
PO4
A
500 5PHOSPHATE ION
lig 2
INI
A
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 3
PO4
B
500 5PHOSPHATE ION
lig 4
INI
B
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 5
PO4
C
500 5PHOSPHATE ION
lig 6
INI
C
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 7
PO4
D
500 5PHOSPHATE ION
lig 8
INI
D
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 9
PO4
E
500 5PHOSPHATE ION
lig 10
INI
E
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 11
PO4
F
500 5PHOSPHATE ION
lig 12
INI
F
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 13
PO4
G
500 5PHOSPHATE ION
lig 14
INI
G
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 15
PO4
H
500 5PHOSPHATE ION
lig 16
INI
H
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 17
PO4
I
500 5PHOSPHATE ION
lig 18
INI
I
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 19
PO4
J
500 5PHOSPHATE ION
lig 20
INI
J
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 21
PO4
K
500 5PHOSPHATE ION
lig 22
INI
K
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 23
PO4
L
500 5PHOSPHATE ION
lig 24
INI
L
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 25
PO4
M
500 5PHOSPHATE ION
lig 26
INI
M
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 27
PO4
N
500 5PHOSPHATE ION
lig 28
INI
N
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 29
PO4
O
500 5PHOSPHATE ION
lig 30
INI
O
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 31
PO4
P
500 5PHOSPHATE ION
lig 32
INI
P
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 33
PO4
Q
500 5PHOSPHATE ION
lig 34
INI
Q
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 35
PO4
R
500 5PHOSPHATE ION
lig 36
INI
R
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 37
PO4
S
500 5PHOSPHATE ION
lig 38
INI
S
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 39
PO4
T
500 5PHOSPHATE ION
lig 40
INI
T
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 41
PO4
U
500 5PHOSPHATE ION
lig 42
INI
U
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 43
PO4
V
500 5PHOSPHATE ION
lig 44
INI
V
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 45
PO4
W
500 5PHOSPHATE ION
lig 46
INI
W
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 47
PO4
X
500 5PHOSPHATE ION
lig 48
INI
X
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 49
PO4
Y
500 5PHOSPHATE ION
lig 50
INI
Y
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 51
PO4
Z
500 5PHOSPHATE ION
lig 52
INI
Z
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 53
PO4
1
500 5PHOSPHATE ION
lig 54
INI
1
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 55
PO4
2
500 5PHOSPHATE ION
lig 56
INI
2
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 57
PO4
3
500 5PHOSPHATE ION
lig 58
INI
3
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID
lig 59
PO4
4
500 5PHOSPHATE ION
lig 60
INI
4
200 215-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMID