Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
1S4D


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 38 ligands in PDB entry 1S4D. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
SAH
A
1501 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 2
GOL
A
1001 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
1002 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
1012 6GLYCEROL
lig 5
SAH
B
1511 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 6
GOL
B
1011 6GLYCEROL
lig 7
SAH
D
2501 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 8
GOL
D
2002 6GLYCEROL
lig 9
GOL
D
2011 6GLYCEROL
lig 10
SAH
E
2511 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 11
GOL
E
2001 6GLYCEROL
lig 12
GOL
E
2003 6GLYCEROL
lig 13
GOL
E
2012 6GLYCEROL
lig 14
SAH
F
3501 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 15
GOL
F
3001 6GLYCEROL
lig 16
GOL
F
3011 6GLYCEROL
lig 17
SAH
G
3511 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 18
GOL
G
3002 6GLYCEROL
lig 19
GOL
G
3003 6GLYCEROL
lig 20
GOL
G
3012 6GLYCEROL
lig 21
SAH
H
4501 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 22
GOL
H
4003 6GLYCEROL
lig 23
GOL
H
4012 6GLYCEROL
lig 24
SAH
I
4511 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 25
GOL
I
4002 6GLYCEROL
lig 26
GOL
I
4011 6GLYCEROL
lig 27
SAH
J
5501 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 28
GOL
J
5002 6GLYCEROL
lig 29
GOL
J
5003 6GLYCEROL
lig 30
GOL
J
5011 6GLYCEROL
lig 31
SAH
K
5511 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 32
GOL
K
5001 6GLYCEROL
lig 33
GOL
K
5012 6GLYCEROL
lig 34
SAH
L
6501 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 35
GOL
L
6001 6GLYCEROL
lig 36
GOL
L
6002 6GLYCEROL
lig 37
SAH
M
6511 26S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
lig 38
GOL
M
6011 6GLYCEROL