Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
1WPB


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 80 ligands in PDB entry 1WPB. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
CL
A
2020 1CHLORIDE ION
lig 2
GOL
A
3037 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
3040 6GLYCEROL
lig 4
CL
B
2010 1CHLORIDE ION
lig 5
GOL
B
3003 6GLYCEROL
lig 6
GOL
B
3015 6GLYCEROL
lig 7
GOL
B
3017 6GLYCEROL
lig 8
GOL
B
3023 6GLYCEROL
lig 9
GOL
B
3024 6GLYCEROL
lig 10
CL
C
2004 1CHLORIDE ION
lig 11
CL
C
2006 1CHLORIDE ION
lig 12
CL
C
2011 1CHLORIDE ION
lig 13
CL
C
2021 1CHLORIDE ION
lig 14
CL
C
2031 1CHLORIDE ION
lig 15
GOL
C
3021 6GLYCEROL
lig 16
GOL
C
3036 6GLYCEROL
lig 17
CL
D
2008 1CHLORIDE ION
lig 18
CL
D
2012 1CHLORIDE ION
lig 19
CL
D
2022 1CHLORIDE ION
lig 20
GOL
D
3005 6GLYCEROL
lig 21
GOL
D
3018 6GLYCEROL
lig 22
GOL
D
3019 6GLYCEROL
lig 23
GOL
D
3020 6GLYCEROL
lig 24
CL
E
2013 1CHLORIDE ION
lig 25
CL
E
2032 1CHLORIDE ION
lig 26
GOL
E
3002 6GLYCEROL
lig 27
GOL
E
3004 6GLYCEROL
lig 28
GOL
E
3022 6GLYCEROL
lig 29
GOL
E
3035 6GLYCEROL
lig 30
CL
F
2023 1CHLORIDE ION
lig 31
CL
F
2034 1CHLORIDE ION
lig 32
CL
F
2035 1CHLORIDE ION
lig 33
GOL
F
3039 6GLYCEROL
lig 34
CL
G
2033 1CHLORIDE ION
lig 35
GOL
G
3001 6GLYCEROL
lig 36
GOL
G
3038 6GLYCEROL
lig 37
CL
H
2005 1CHLORIDE ION
lig 38
CL
H
2014 1CHLORIDE ION
lig 39
CL
H
2024 1CHLORIDE ION
lig 40
GOL
H
3006 6GLYCEROL
lig 41
GOL
H
3016 6GLYCEROL
lig 42
GOL
H
3025 6GLYCEROL
lig 43
CL
I
2001 1CHLORIDE ION
lig 44
CL
I
2007 1CHLORIDE ION
lig 45
CL
I
2015 1CHLORIDE ION
lig 46
CL
I
2025 1CHLORIDE ION
lig 47
GOL
I
3031 6GLYCEROL
lig 48
GOL
I
3032 6GLYCEROL
lig 49
CL
J
2002 1CHLORIDE ION
lig 50
CL
J
2016 1CHLORIDE ION
lig 51
CL
J
2026 1CHLORIDE ION
lig 52
GOL
J
3030 6GLYCEROL
lig 53
GOL
J
3033 6GLYCEROL
lig 54
CL
K
2003 1CHLORIDE ION
lig 55
CL
K
2027 1CHLORIDE ION
lig 56
GOL
K
3009 6GLYCEROL
lig 57
GOL
K
3010 6GLYCEROL
lig 58
GOL
K
3011 6GLYCEROL
lig 59
GOL
K
3041 6GLYCEROL
lig 60
CL
L
2009 1CHLORIDE ION
lig 61
CL
L
2028 1CHLORIDE ION
lig 62
GOL
L
3027 6GLYCEROL
lig 63
GOL
L
3028 6GLYCEROL
lig 64
CL
M
2017 1CHLORIDE ION
lig 65
CL
M
2029 1CHLORIDE ION
lig 66
GOL
M
3007 6GLYCEROL
lig 67
GOL
M
3042 6GLYCEROL
lig 68
GOL
M
3043 6GLYCEROL
lig 69
CL
N
2030 1CHLORIDE ION
lig 70
GOL
N
3008 6GLYCEROL
lig 71
GOL
N
3012 6GLYCEROL
lig 72
GOL
N
3029 6GLYCEROL
lig 73
GOL
N
3044 6GLYCEROL
lig 74
CL
O
2018 1CHLORIDE ION
lig 75
CL
O
2036 1CHLORIDE ION
lig 76
GOL
O
3013 6GLYCEROL
lig 77
GOL
O
3026 6GLYCEROL
lig 78
CL
P
2019 1CHLORIDE ION
lig 79
GOL
P
3014 6GLYCEROL
lig 80
GOL
P
3034 6GLYCEROL