Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
1Y2K


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 39 ligands in PDB entry 1Y2K. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
ZN
A
1001 1ZINC ION
lig 2
MG
A
1002 1MAGNESIUM ION
lig 3
7DE
A
602 21 ACID ETHYL ESTER
lig 4
EDO
A
702 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
704 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
707 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
712 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
715 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
716 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
719 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
720 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
722 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
723 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
724 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
729 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
731 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
732 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
733 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
736 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
738 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
739 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
ZN
B
1001 1ZINC ION
lig 23
MG
B
1002 1MAGNESIUM ION
lig 24
7DE
B
601 21 ACID ETHYL ESTER
lig 25
EDO
B
701 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
B
706 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
B
708 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
B
709 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
B
717 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
B
718 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
B
725 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
B
726 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
B
727 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
B
728 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
B
730 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
B
734 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
B
735 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
B
737 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
B
740 41,2-ETHANEDIOL