Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
1YCE


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 88 ligands in PDB entry 1YCE. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
NA
A
201 1SODIUM ION
lig 2
F09
A
314 10NONAN-1-OL
lig 3
NA
B
201 1SODIUM ION
lig 4
F09
B
314 10NONAN-1-OL
lig 5
NA
C
201 1SODIUM ION
lig 6
F09
C
314 10NONAN-1-OL
lig 7
NA
D
201 1SODIUM ION
lig 8
F09
D
314 10NONAN-1-OL
lig 9
NA
E
201 1SODIUM ION
lig 10
F09
E
314 10NONAN-1-OL
lig 11
NA
F
201 1SODIUM ION
lig 12
F09
F
314 10NONAN-1-OL
lig 13
NA
G
201 1SODIUM ION
lig 14
F09
G
314 10NONAN-1-OL
lig 15
NA
H
201 1SODIUM ION
lig 16
F09
H
314 10NONAN-1-OL
lig 17
NA
I
201 1SODIUM ION
lig 18
F09
I
314 10NONAN-1-OL
lig 19
NA
J
201 1SODIUM ION
lig 20
F09
J
314 10NONAN-1-OL
lig 21
NA
K
201 1SODIUM ION
lig 22
F09
K
314 10NONAN-1-OL
lig 23
NA
L
201 1SODIUM ION
lig 24
F09
L
314 10NONAN-1-OL
lig 25
NA
M
201 1SODIUM ION
lig 26
F09
M
314 10NONAN-1-OL
lig 27
NA
N
201 1SODIUM ION
lig 28
F09
N
314 10NONAN-1-OL
lig 29
NA
O
201 1SODIUM ION
lig 30
F09
O
314 10NONAN-1-OL
lig 31
NA
P
201 1SODIUM ION
lig 32
F09
P
314 10NONAN-1-OL
lig 33
NA
Q
201 1SODIUM ION
lig 34
F09
Q
314 10NONAN-1-OL
lig 35
NA
R
201 1SODIUM ION
lig 36
F09
R
314 10NONAN-1-OL
lig 37
NA
S
201 1SODIUM ION
lig 38
F09
S
314 10NONAN-1-OL
lig 39
NA
T
201 1SODIUM ION
lig 40
F09
T
314 10NONAN-1-OL
lig 41
NA
U
201 1SODIUM ION
lig 42
F09
U
314 10NONAN-1-OL
lig 43
NA
V
201 1SODIUM ION
lig 44
F09
V
314 10NONAN-1-OL
lig 45
NA
a
201 1SODIUM ION
lig 46
F09
a
314 10NONAN-1-OL
lig 47
NA
b
201 1SODIUM ION
lig 48
F09
b
314 10NONAN-1-OL
lig 49
NA
c
201 1SODIUM ION
lig 50
F09
c
314 10NONAN-1-OL
lig 51
NA
d
201 1SODIUM ION
lig 52
F09
d
314 10NONAN-1-OL
lig 53
NA
e
201 1SODIUM ION
lig 54
F09
e
314 10NONAN-1-OL
lig 55
NA
f
201 1SODIUM ION
lig 56
F09
f
314 10NONAN-1-OL
lig 57
NA
g
201 1SODIUM ION
lig 58
F09
g
314 10NONAN-1-OL
lig 59
NA
h
201 1SODIUM ION
lig 60
F09
h
314 10NONAN-1-OL
lig 61
NA
i
201 1SODIUM ION
lig 62
F09
i
314 10NONAN-1-OL
lig 63
NA
j
201 1SODIUM ION
lig 64
F09
j
314 10NONAN-1-OL
lig 65
NA
k
201 1SODIUM ION
lig 66
F09
k
314 10NONAN-1-OL
lig 67
NA
l
201 1SODIUM ION
lig 68
F09
l
314 10NONAN-1-OL
lig 69
NA
m
201 1SODIUM ION
lig 70
F09
m
314 10NONAN-1-OL
lig 71
NA
n
201 1SODIUM ION
lig 72
F09
n
314 10NONAN-1-OL
lig 73
NA
o
201 1SODIUM ION
lig 74
F09
o
314 10NONAN-1-OL
lig 75
NA
p
201 1SODIUM ION
lig 76
F09
p
314 10NONAN-1-OL
lig 77
NA
q
201 1SODIUM ION
lig 78
F09
q
314 10NONAN-1-OL
lig 79
NA
r
201 1SODIUM ION
lig 80
F09
r
314 10NONAN-1-OL
lig 81
NA
s
201 1SODIUM ION
lig 82
F09
s
314 10NONAN-1-OL
lig 83
NA
t
201 1SODIUM ION
lig 84
F09
t
314 10NONAN-1-OL
lig 85
NA
u
201 1SODIUM ION
lig 86
F09
u
314 10NONAN-1-OL
lig 87
NA
v
201 1SODIUM ION
lig 88
F09
v
314 10NONAN-1-OL