Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2AV1


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 24 ligands in PDB entry 2AV1. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
GOL
A
902 6GLYCEROL
lig 2
GOL
A
907 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
910 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
912 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
913 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
920 6GLYCEROL
lig 7
SCN
B
801 3THIOCYANATE ION
lig 8
GOL
B
903 6GLYCEROL
lig 9
GOL
B
906 6GLYCEROL
lig 10
GOL
B
909 6GLYCEROL
lig 11
GOL
B
919 6GLYCEROL
lig 12
GOL
B
921 6GLYCEROL
lig 13
GOL
B
923 6GLYCEROL
lig 14
GOL
C
908 6GLYCEROL
lig 15
GOL
D
904 6GLYCEROL
lig 16
GOL
D
905 6GLYCEROL
lig 17
GOL
D
914 6GLYCEROL
lig 18
GOL
D
915 6GLYCEROL
lig 19
GOL
D
917 6GLYCEROL
lig 20
GOL
D
918 6GLYCEROL
lig 21
GOL
D
922 6GLYCEROL
lig 22
GOL
E
901 6GLYCEROL
lig 23
GOL
E
911 6GLYCEROL
lig 24
GOL
E
916 6GLYCEROL