Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2G50


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 102 ligands in PDB entry 2G50. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
MN
A
640 1MANGANESE (II) ION
lig 2
K
A
6501 1POTASSIUM ION
lig 3
NA
A
6019 1SODIUM ION
lig 4
NA
A
6023 1SODIUM ION
lig 5
ALA
A
6101 6ALANINE
lig 6
PYR
A
600 6PYRUVIC ACID
lig 7
EDO
A
6043 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
6050 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
6051 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
GOL
A
6201 6GLYCEROL
lig 11
GOL
A
6301 6GLYCEROL
lig 12
GOL
A
6002 6GLYCEROL
lig 13
MN
B
640 1MANGANESE (II) ION
lig 14
K
B
6502 1POTASSIUM ION
lig 15
NA
B
6024 1SODIUM ION
lig 16
ALA
B
6102 6ALANINE
lig 17
PYR
B
600 6PYRUVIC ACID
lig 18
EDO
B
6013 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
B
6032 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
B
6047 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
B
6048 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
ETE
B
6018 142-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}
lig 23
GOL
B
6202 6GLYCEROL
lig 24
GOL
B
6302 6GLYCEROL
lig 25
GOL
B
6007 6GLYCEROL
lig 26
MN
C
640 1MANGANESE (II) ION
lig 27
K
C
6503 1POTASSIUM ION
lig 28
NA
C
6025 1SODIUM ION
lig 29
ALA
C
6103 6ALANINE
lig 30
PYR
C
600 6PYRUVIC ACID
lig 31
EDO
C
6014 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
C
6044 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
GOL
C
6203 6GLYCEROL
lig 34
GOL
C
6303 6GLYCEROL
lig 35
GOL
C
6055 6GLYCEROL
lig 36
GOL
C
6056 6GLYCEROL
lig 37
MN
D
640 1MANGANESE (II) ION
lig 38
K
D
6504 1POTASSIUM ION
lig 39
NA
D
6020 1SODIUM ION
lig 40
NA
D
6026 1SODIUM ION
lig 41
ALA
D
6104 6ALANINE
lig 42
PYR
D
600 6PYRUVIC ACID
lig 43
EDO
D
6011 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
D
6017 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
D
6033 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
D
6040 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
GOL
D
6204 6GLYCEROL
lig 48
GOL
D
6304 6GLYCEROL
lig 49
MN
E
640 1MANGANESE (II) ION
lig 50
K
E
6505 1POTASSIUM ION
lig 51
NA
E
6021 1SODIUM ION
lig 52
NA
E
6030 1SODIUM ION
lig 53
ALA
E
6105 6ALANINE
lig 54
PYR
E
600 6PYRUVIC ACID
lig 55
EDO
E
6015 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
EDO
E
6038 41,2-ETHANEDIOL
lig 57
EDO
E
6039 41,2-ETHANEDIOL
lig 58
EDO
E
6045 41,2-ETHANEDIOL
lig 59
EDO
E
6046 41,2-ETHANEDIOL
lig 60
EDO
E
6049 41,2-ETHANEDIOL
lig 61
GOL
E
6205 6GLYCEROL
lig 62
GOL
E
6305 6GLYCEROL
lig 63
GOL
E
6031 6GLYCEROL
lig 64
MN
F
640 1MANGANESE (II) ION
lig 65
K
F
6506 1POTASSIUM ION
lig 66
NA
F
6027 1SODIUM ION
lig 67
ALA
F
6106 6ALANINE
lig 68
PYR
F
600 6PYRUVIC ACID
lig 69
EDO
F
6012 41,2-ETHANEDIOL
lig 70
EDO
F
6036 41,2-ETHANEDIOL
lig 71
GOL
F
6206 6GLYCEROL
lig 72
GOL
F
6306 6GLYCEROL
lig 73
GOL
F
6001 6GLYCEROL
lig 74
GOL
F
6005 6GLYCEROL
lig 75
GOL
F
6010 6GLYCEROL
lig 76
GOL
F
6057 6GLYCEROL
lig 77
MN
G
640 1MANGANESE (II) ION
lig 78
K
G
6507 1POTASSIUM ION
lig 79
NA
G
6028 1SODIUM ION
lig 80
ALA
G
6107 6ALANINE
lig 81
PYR
G
600 6PYRUVIC ACID
lig 82
EDO
G
6016 41,2-ETHANEDIOL
lig 83
EDO
G
6052 41,2-ETHANEDIOL
lig 84
GOL
G
6207 6GLYCEROL
lig 85
GOL
G
6307 6GLYCEROL
lig 86
GOL
G
6004 6GLYCEROL
lig 87
MN
H
640 1MANGANESE (II) ION
lig 88
K
H
6508 1POTASSIUM ION
lig 89
NA
H
6022 1SODIUM ION
lig 90
NA
H
6029 1SODIUM ION
lig 91
ALA
H
6108 6ALANINE
lig 92
PYR
H
600 6PYRUVIC ACID
lig 93
EDO
H
6034 41,2-ETHANEDIOL
lig 94
EDO
H
6037 41,2-ETHANEDIOL
lig 95
EDO
H
6041 41,2-ETHANEDIOL
lig 96
EDO
H
6042 41,2-ETHANEDIOL
lig 97
EDO
H
6053 41,2-ETHANEDIOL
lig 98
EDO
H
6054 41,2-ETHANEDIOL
lig 99
GOL
H
6208 6GLYCEROL
lig 100
GOL
H
6308 6GLYCEROL
lig 101
GOL
H
6006 6GLYCEROL
lig 102
GOL
H
6008 6GLYCEROL