Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2VQU


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 77 ligands in PDB entry 2VQU. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
EDO
A
1865 41,2-ETHANEDIOL
lig 2
NOY
A
1866 11(2R,3S,4R,5R)-5-(HYDROXYMETHYL)PIPERIDINE-
lig 3
EDO
A
1867 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
1868 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
1869 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
1876 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
1877 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
1878 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
1879 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
1880 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
1881 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
1882 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
1883 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
BR
A
1884 1BROMIDE ION
lig 21
BR
A
1885 1BROMIDE ION
lig 22
BR
A
1886 1BROMIDE ION
lig 23
EDO
A
1887 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
CL
A
1888 1CHLORIDE ION
lig 25
EDO
A
1889 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
BR
A
1891 1BROMIDE ION
lig 27
CL
A
1892 1CHLORIDE ION
lig 28
CL
A
1893 1CHLORIDE ION
lig 29
EDO
A
1894 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
BR
A
1895 1BROMIDE ION
lig 31
BR
A
1896 1BROMIDE ION
lig 32
BR
A
1897 1BROMIDE ION
lig 33
CL
A
1898 1CHLORIDE ION
lig 34
EDO
A
1899 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
A
1900 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
A
1901 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
A
1902 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
A
1903 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
A
1904 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
B
1868 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
NOY
B
1869 11(2R,3S,4R,5R)-5-(HYDROXYMETHYL)PIPERIDINE-
lig 42
EDO
B
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
B
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
B
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
B
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
B
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
B
1876 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
B
1877 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
B
1878 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
B
1879 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
B
1880 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
B
1881 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
B
1882 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
B
1883 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
EDO
B
1884 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
EDO
B
1885 41,2-ETHANEDIOL
lig 57
EDO
B
1886 41,2-ETHANEDIOL
lig 58
EDO
B
1887 41,2-ETHANEDIOL
lig 59
BR
B
1888 1BROMIDE ION
lig 60
BR
B
1889 1BROMIDE ION
lig 61
CL
B
1890 1CHLORIDE ION
lig 62
CL
B
1891 1CHLORIDE ION
lig 63
CL
B
1892 1CHLORIDE ION
lig 64
BR
B
1893 1BROMIDE ION
lig 65
EDO
B
1894 41,2-ETHANEDIOL
lig 66
BR
B
1896 1BROMIDE ION
lig 67
CL
B
1897 1CHLORIDE ION
lig 68
EDO
B
1898 41,2-ETHANEDIOL
lig 69
BR
B
1899 1BROMIDE ION
lig 70
EDO
B
1900 41,2-ETHANEDIOL
lig 71
EDO
B
1901 41,2-ETHANEDIOL
lig 72
EDO
B
1902 41,2-ETHANEDIOL
lig 73
EDO
B
1903 41,2-ETHANEDIOL
lig 74
EDO
B
1904 41,2-ETHANEDIOL
lig 75
EDO
B
1905 41,2-ETHANEDIOL
lig 76
EDO
B
1906 41,2-ETHANEDIOL
lig 77
EDO
B
1907 41,2-ETHANEDIOL