Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2JD8


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 152 ligands in PDB entry 2JD8. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
ZN
0
201 1ZINC ION
lig 2
ZN
0
202 1ZINC ION
lig 3
FE
0
203 1FE (III) ION
lig 4
ZN
1
201 1ZINC ION
lig 5
ZN
1
202 1ZINC ION
lig 6
FE
1
203 1FE (III) ION
lig 7
SO4
1
1670 5SULFATE ION
lig 8
ZN
2
201 1ZINC ION
lig 9
ZN
2
202 1ZINC ION
lig 10
FE
2
203 1FE (III) ION
lig 11
SO4
2
1670 5SULFATE ION
lig 12
ZN
3
201 1ZINC ION
lig 13
ZN
3
202 1ZINC ION
lig 14
FE
3
203 1FE (III) ION
lig 15
SO4
3
1670 5SULFATE ION
lig 16
SO4
3
1671 5SULFATE ION
lig 17
SO4
3
1672 5SULFATE ION
lig 18
ZN
4
201 1ZINC ION
lig 19
ZN
4
202 1ZINC ION
lig 20
FE
4
203 1FE (III) ION
lig 21
SO4
4
1670 5SULFATE ION
lig 22
ZN
5
201 1ZINC ION
lig 23
ZN
5
202 1ZINC ION
lig 24
FE
5
203 1FE (III) ION
lig 25
SO4
5
1670 5SULFATE ION
lig 26
SO4
5
1671 5SULFATE ION
lig 27
ZN
6
201 1ZINC ION
lig 28
ZN
6
202 1ZINC ION
lig 29
FE
6
203 1FE (III) ION
lig 30
SO4
6
1670 5SULFATE ION
lig 31
ZN
7
201 1ZINC ION
lig 32
ZN
7
202 1ZINC ION
lig 33
FE
7
203 1FE (III) ION
lig 34
SO4
7
1670 5SULFATE ION
lig 35
ZN
8
201 1ZINC ION
lig 36
ZN
8
202 1ZINC ION
lig 37
FE
8
203 1FE (III) ION
lig 38
SO4
8
1670 5SULFATE ION
lig 39
ZN
9
201 1ZINC ION
lig 40
ZN
9
202 1ZINC ION
lig 41
FE
9
203 1FE (III) ION
lig 42
ZN
A
201 1ZINC ION
lig 43
ZN
A
202 1ZINC ION
lig 44
FE
A
203 1FE (III) ION
lig 45
SO4
A
1170 5SULFATE ION
lig 46
SO4
A
1171 5SULFATE ION
lig 47
ZN
B
201 1ZINC ION
lig 48
ZN
B
202 1ZINC ION
lig 49
FE
B
203 1FE (III) ION
lig 50
SO4
B
1170 5SULFATE ION
lig 51
SO4
B
1171 5SULFATE ION
lig 52
ZN
C
201 1ZINC ION
lig 53
ZN
C
202 1ZINC ION
lig 54
FE
C
203 1FE (III) ION
lig 55
SO4
C
1170 5SULFATE ION
lig 56
SO4
C
1171 5SULFATE ION
lig 57
ZN
D
201 1ZINC ION
lig 58
ZN
D
202 1ZINC ION
lig 59
FE
D
203 1FE (III) ION
lig 60
SO4
D
1170 5SULFATE ION
lig 61
ZN
E
201 1ZINC ION
lig 62
ZN
E
202 1ZINC ION
lig 63
FE
E
203 1FE (III) ION
lig 64
SO4
E
1170 5SULFATE ION
lig 65
ZN
F
201 1ZINC ION
lig 66
ZN
F
202 1ZINC ION
lig 67
FE
F
203 1FE (III) ION
lig 68
SO4
F
1170 5SULFATE ION
lig 69
ZN
G
201 1ZINC ION
lig 70
ZN
G
202 1ZINC ION
lig 71
FE
G
203 1FE (III) ION
lig 72
SO4
G
1170 5SULFATE ION
lig 73
ZN
H
201 1ZINC ION
lig 74
ZN
H
202 1ZINC ION
lig 75
FE
H
203 1FE (III) ION
lig 76
SO4
H
1170 5SULFATE ION
lig 77
ZN
I
201 1ZINC ION
lig 78
ZN
I
202 1ZINC ION
lig 79
FE
I
203 1FE (III) ION
lig 80
SO4
I
1170 5SULFATE ION
lig 81
SO4
I
1171 5SULFATE ION
lig 82
ZN
J
201 1ZINC ION
lig 83
ZN
J
202 1ZINC ION
lig 84
FE
J
203 1FE (III) ION
lig 85
SO4
J
1170 5SULFATE ION
lig 86
SO4
J
1171 5SULFATE ION
lig 87
SO4
J
1172 5SULFATE ION
lig 88
ZN
K
201 1ZINC ION
lig 89
ZN
K
202 1ZINC ION
lig 90
FE
K
203 1FE (III) ION
lig 91
SO4
K
1170 5SULFATE ION
lig 92
SO4
K
1171 5SULFATE ION
lig 93
ZN
L
201 1ZINC ION
lig 94
ZN
L
202 1ZINC ION
lig 95
FE
L
203 1FE (III) ION
lig 96
ZN
M
201 1ZINC ION
lig 97
ZN
M
202 1ZINC ION
lig 98
FE
M
203 1FE (III) ION
lig 99
SO4
M
1170 5SULFATE ION
lig 100
ZN
N
201 1ZINC ION
lig 101
ZN
N
202 1ZINC ION
lig 102
FE
N
203 1FE (III) ION
lig 103
ZN
O
201 1ZINC ION
lig 104
ZN
O
202 1ZINC ION
lig 105
FE
O
203 1FE (III) ION
lig 106
SO4
O
1170 5SULFATE ION
lig 107
SO4
O
1171 5SULFATE ION
lig 108
ZN
P
201 1ZINC ION
lig 109
ZN
P
202 1ZINC ION
lig 110
FE
P
203 1FE (III) ION
lig 111
ZN
Q
201 1ZINC ION
lig 112
ZN
Q
202 1ZINC ION
lig 113
FE
Q
203 1FE (III) ION
lig 114
SO4
Q
1170 5SULFATE ION
lig 115
ZN
R
201 1ZINC ION
lig 116
ZN
R
202 1ZINC ION
lig 117
FE
R
203 1FE (III) ION
lig 118
ZN
S
201 1ZINC ION
lig 119
ZN
S
202 1ZINC ION
lig 120
FE
S
203 1FE (III) ION
lig 121
SO4
S
1668 5SULFATE ION
lig 122
SO4
S
1669 5SULFATE ION
lig 123
ZN
T
201 1ZINC ION
lig 124
ZN
T
202 1ZINC ION
lig 125
FE
T
203 1FE (III) ION
lig 126
SO4
T
1668 5SULFATE ION
lig 127
ZN
U
201 1ZINC ION
lig 128
ZN
U
202 1ZINC ION
lig 129
FE
U
203 1FE (III) ION
lig 130
ZN
V
201 1ZINC ION
lig 131
ZN
V
202 1ZINC ION
lig 132
FE
V
203 1FE (III) ION
lig 133
SO4
V
1668 5SULFATE ION
lig 134
SO4
V
1669 5SULFATE ION
lig 135
ZN
W
201 1ZINC ION
lig 136
ZN
W
202 1ZINC ION
lig 137
FE
W
203 1FE (III) ION
lig 138
SO4
W
1668 5SULFATE ION
lig 139
SO4
W
1669 5SULFATE ION
lig 140
SO4
W
1670 5SULFATE ION
lig 141
ZN
X
201 1ZINC ION
lig 142
ZN
X
202 1ZINC ION
lig 143
FE
X
203 1FE (III) ION
lig 144
SO4
X
1668 5SULFATE ION
lig 145
ZN
Y
201 1ZINC ION
lig 146
ZN
Y
202 1ZINC ION
lig 147
FE
Y
203 1FE (III) ION
lig 148
SO4
Y
1668 5SULFATE ION
lig 149
ZN
Z
201 1ZINC ION
lig 150
ZN
Z
202 1ZINC ION
lig 151
FE
Z
203 1FE (III) ION
lig 152
SO4
Z
1668 5SULFATE ION