Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2NV2


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 42 ligands in PDB entry 2NV2. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
CL
A
6001 1CHLORIDE ION
lig 2
EDO
A
6002 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
6030 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
6031 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
GLN
B
6004 10GLUTAMINE
lig 6
CL
C
6005 1CHLORIDE ION
lig 7
EDO
C
6006 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
C
6026 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
GLN
D
6008 10GLUTAMINE
lig 10
CL
E
6009 1CHLORIDE ION
lig 11
EDO
E
6010 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
E
6047 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
GLN
F
6012 10GLUTAMINE
lig 14
CL
G
6013 1CHLORIDE ION
lig 15
EDO
G
6043 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
GLN
H
6016 10GLUTAMINE
lig 17
CL
I
6017 1CHLORIDE ION
lig 18
EDO
I
6018 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
I
6038 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
I
6039 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
GLN
J
6020 10GLUTAMINE
lig 22
CL
K
6021 1CHLORIDE ION
lig 23
EDO
K
6022 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
GLN
L
6024 10GLUTAMINE
lig 25
CL
M
6025 1CHLORIDE ION
lig 26
EDO
M
6007 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
GLN
N
6028 10GLUTAMINE
lig 28
CL
O
6029 1CHLORIDE ION
lig 29
GLN
P
6032 10GLUTAMINE
lig 30
CL
Q
6033 1CHLORIDE ION
lig 31
EDO
Q
6034 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
Q
6035 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
GLN
R
6036 10GLUTAMINE
lig 34
CL
S
6037 1CHLORIDE ION
lig 35
GLN
T
6040 10GLUTAMINE
lig 36
CL
U
6041 1CHLORIDE ION
lig 37
EDO
U
6014 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
U
6042 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
GLN
V
6044 10GLUTAMINE
lig 40
CL
W
6045 1CHLORIDE ION
lig 41
EDO
W
6046 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
GLN
X
6048 9GLUTAMINE