Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2OOV


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 44 ligands in PDB entry 2OOV. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
TPQ
A
405 145-(2-CARBOXY-2-AMINOETHYL)-2-HYDROXY-1,4-B
lig 2
SME
A
634 9METHIONINE SULFOXIDE
lig 3
TPQ
B
405 145-(2-CARBOXY-2-AMINOETHYL)-2-HYDROXY-1,4-B
lig 4
SME
B
634 9METHIONINE SULFOXIDE
lig 5
TPQ
C
405 145-(2-CARBOXY-2-AMINOETHYL)-2-HYDROXY-1,4-B
lig 6
TPQ
D
405 145-(2-CARBOXY-2-AMINOETHYL)-2-HYDROXY-1,4-B
lig 7
TPQ
E
405 145-(2-CARBOXY-2-AMINOETHYL)-2-HYDROXY-1,4-B
lig 8
TPQ
F
405 145-(2-CARBOXY-2-AMINOETHYL)-2-HYDROXY-1,4-B
lig 9
CU
A
801 1COPPER (II) ION
lig 10
GOL
A
6005 6GLYCEROL
lig 11
GOL
A
6012 6GLYCEROL
lig 12
GOL
A
6013 6GLYCEROL
lig 13
GOL
A
6017 6GLYCEROL
lig 14
GOL
A
6018 6GLYCEROL
lig 15
GOL
A
6027 6GLYCEROL
lig 16
CU
B
801 1COPPER (II) ION
lig 17
GOL
B
6004 6GLYCEROL
lig 18
GOL
B
6009 6GLYCEROL
lig 19
GOL
B
6023 6GLYCEROL
lig 20
GOL
B
6024 6GLYCEROL
lig 21
GOL
B
6025 6GLYCEROL
lig 22
GOL
B
6026 6GLYCEROL
lig 23
CU
C
801 1COPPER (II) ION
lig 24
PO4
C
6010 5PHOSPHATE ION
lig 25
GOL
C
6002 6GLYCEROL
lig 26
GOL
C
6007 6GLYCEROL
lig 27
GOL
C
6021 6GLYCEROL
lig 28
GOL
C
6029 6GLYCEROL
lig 29
CU
D
801 1COPPER (II) ION
lig 30
GOL
D
6028 6GLYCEROL
lig 31
GOL
D
6030 6GLYCEROL
lig 32
CU
E
801 1COPPER (II) ION
lig 33
GOL
E
6014 6GLYCEROL
lig 34
GOL
E
6015 6GLYCEROL
lig 35
GOL
E
6016 6GLYCEROL
lig 36
GOL
E
6019 6GLYCEROL
lig 37
GOL
E
6020 6GLYCEROL
lig 38
GOL
E
6022 6GLYCEROL
lig 39
CU
F
801 1COPPER (II) ION
lig 40
PO4
F
6011 5PHOSPHATE ION
lig 41
GOL
F
6001 6GLYCEROL
lig 42
GOL
F
6003 6GLYCEROL
lig 43
GOL
F
6006 6GLYCEROL
lig 44
GOL
F
6008 6GLYCEROL