Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2OQE


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 87 ligands in PDB entry 2OQE. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
TPQ
A
405 145-(2-CARBOXY-2-AMINOETHYL)-2-HYDROXY-1,4-B
lig 2
SME
A
634 9METHIONINE SULFOXIDE
lig 3
TPQ
B
405 145-(2-CARBOXY-2-AMINOETHYL)-2-HYDROXY-1,4-B
lig 4
SME
B
634 9METHIONINE SULFOXIDE
lig 5
TPQ
C
405 145-(2-CARBOXY-2-AMINOETHYL)-2-HYDROXY-1,4-B
lig 6
TPQ
D
405 145-(2-CARBOXY-2-AMINOETHYL)-2-HYDROXY-1,4-B
lig 7
TPQ
E
405 145-(2-CARBOXY-2-AMINOETHYL)-2-HYDROXY-1,4-B
lig 8
TPQ
F
405 145-(2-CARBOXY-2-AMINOETHYL)-2-HYDROXY-1,4-B
lig 9
CU
A
801 1COPPER (II) ION
lig 10
XE
A
901 1XENON
lig 11
XE
A
902 1XENON
lig 12
XE
A
903 1XENON
lig 13
XE
A
904 1XENON
lig 14
GOL
A
4002 6GLYCEROL
lig 15
GOL
A
4004 6GLYCEROL
lig 16
GOL
A
4007 6GLYCEROL
lig 17
GOL
A
4011 6GLYCEROL
lig 18
GOL
A
4019 6GLYCEROL
lig 19
GOL
A
4021 6GLYCEROL
lig 20
GOL
A
4024 6GLYCEROL
lig 21
GOL
A
4029 6GLYCEROL
lig 22
GOL
A
4044 6GLYCEROL
lig 23
GOL
A
4049 6GLYCEROL
lig 24
CU
B
801 1COPPER (II) ION
lig 25
XE
B
901 1XENON
lig 26
XE
B
902 1XENON
lig 27
XE
B
903 1XENON
lig 28
XE
B
904 1XENON
lig 29
GOL
B
4001 6GLYCEROL
lig 30
GOL
B
4009 6GLYCEROL
lig 31
GOL
B
4013 6GLYCEROL
lig 32
GOL
B
4014 6GLYCEROL
lig 33
GOL
B
4015 6GLYCEROL
lig 34
GOL
B
4018 6GLYCEROL
lig 35
GOL
B
4035 6GLYCEROL
lig 36
GOL
B
4036 6GLYCEROL
lig 37
GOL
B
4037 6GLYCEROL
lig 38
GOL
B
4048 6GLYCEROL
lig 39
CU
C
801 1COPPER (II) ION
lig 40
XE
C
901 1XENON
lig 41
XE
C
902 1XENON
lig 42
XE
C
903 1XENON
lig 43
XE
C
904 1XENON
lig 44
GOL
C
4005 6GLYCEROL
lig 45
GOL
C
4016 6GLYCEROL
lig 46
GOL
C
4025 6GLYCEROL
lig 47
GOL
C
4030 6GLYCEROL
lig 48
GOL
C
4043 6GLYCEROL
lig 49
CU
D
801 1COPPER (II) ION
lig 50
XE
D
901 1XENON
lig 51
XE
D
902 1XENON
lig 52
XE
D
903 1XENON
lig 53
XE
D
904 1XENON
lig 54
GOL
D
4008 6GLYCEROL
lig 55
GOL
D
4023 6GLYCEROL
lig 56
GOL
D
4027 6GLYCEROL
lig 57
GOL
D
4031 6GLYCEROL
lig 58
GOL
D
4032 6GLYCEROL
lig 59
GOL
D
4040 6GLYCEROL
lig 60
GOL
D
4045 6GLYCEROL
lig 61
CU
E
801 1COPPER (II) ION
lig 62
XE
E
901 1XENON
lig 63
XE
E
902 1XENON
lig 64
XE
E
903 1XENON
lig 65
XE
E
904 1XENON
lig 66
GOL
E
4003 6GLYCEROL
lig 67
GOL
E
4020 6GLYCEROL
lig 68
GOL
E
4022 6GLYCEROL
lig 69
GOL
E
4026 6GLYCEROL
lig 70
GOL
E
4033 6GLYCEROL
lig 71
GOL
E
4034 6GLYCEROL
lig 72
GOL
E
4038 6GLYCEROL
lig 73
GOL
E
4039 6GLYCEROL
lig 74
GOL
E
4041 6GLYCEROL
lig 75
GOL
E
4047 6GLYCEROL
lig 76
CU
F
801 1COPPER (II) ION
lig 77
XE
F
901 1XENON
lig 78
XE
F
902 1XENON
lig 79
XE
F
903 1XENON
lig 80
XE
F
904 1XENON
lig 81
GOL
F
4006 6GLYCEROL
lig 82
GOL
F
4012 6GLYCEROL
lig 83
GOL
F
4017 6GLYCEROL
lig 84
GOL
F
4028 6GLYCEROL
lig 85
GOL
F
4042 6GLYCEROL
lig 86
GOL
F
4046 6GLYCEROL
lig 87
GOL
F
4050 6GLYCEROL