Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2PKH


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 32 ligands in PDB entry 2PKH. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
EDO
A
1001 41,2-ETHANEDIOL
lig 2
EDO
A
1004 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
1009 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
1014 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
1024 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
B
1010 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
B
1016 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
B
1021 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
B
1026 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
B
1029 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
B
1032 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
C
1002 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
C
1012 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
C
1017 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
D
1003 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
D
1006 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
D
1013 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
E
1005 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
E
1011 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
E
1020 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
E
1027 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
E
1030 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
F
1007 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
F
1015 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
F
1028 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
G
1018 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
G
1023 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
H
1008 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
H
1019 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
H
1022 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
H
1025 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
H
1031 41,2-ETHANEDIOL