Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2QA4


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 235 ligands in PDB entry 2QA4. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
OMU
0
2587 21O2'-METHYLURIDINE 5'-MONOPHOSPHATE
lig 2
OMG
0
2588 24O2'-METHYLGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE
lig 3
UR3
0
2619 213-METHYLURIDINE-5'-MONOPHOSHATE
lig 4
PSU
0
2621 20PSEUDOURIDINE-5'-MONOPHOSPHATE
lig 5
MG
0
1 1MAGNESIUM ION
lig 6
MG
0
2924 1MAGNESIUM ION
lig 7
MG
0
2925 1MAGNESIUM ION
lig 8
MG
0
2926 1MAGNESIUM ION
lig 9
MG
0
2927 1MAGNESIUM ION
lig 10
MG
0
2928 1MAGNESIUM ION
lig 11
MG
0
2929 1MAGNESIUM ION
lig 12
MG
0
2930 1MAGNESIUM ION
lig 13
MG
0
2931 1MAGNESIUM ION
lig 14
MG
0
2932 1MAGNESIUM ION
lig 15
MG
0
2933 1MAGNESIUM ION
lig 16
MG
0
2934 1MAGNESIUM ION
lig 17
MG
0
2935 1MAGNESIUM ION
lig 18
MG
0
2936 1MAGNESIUM ION
lig 19
MG
0
2937 1MAGNESIUM ION
lig 20
MG
0
2938 1MAGNESIUM ION
lig 21
MG
0
2939 1MAGNESIUM ION
lig 22
MG
0
2940 1MAGNESIUM ION
lig 23
MG
0
2941 1MAGNESIUM ION
lig 24
MG
0
2942 1MAGNESIUM ION
lig 25
MG
0
2943 1MAGNESIUM ION
lig 26
MG
0
2944 1MAGNESIUM ION
lig 27
MG
0
2945 1MAGNESIUM ION
lig 28
MG
0
2946 1MAGNESIUM ION
lig 29
MG
0
2947 1MAGNESIUM ION
lig 30
MG
0
2948 1MAGNESIUM ION
lig 31
MG
0
2949 1MAGNESIUM ION
lig 32
MG
0
2950 1MAGNESIUM ION
lig 33
MG
0
2951 1MAGNESIUM ION
lig 34
MG
0
2952 1MAGNESIUM ION
lig 35
MG
0
2953 1MAGNESIUM ION
lig 36
MG
0
2954 1MAGNESIUM ION
lig 37
MG
0
2955 1MAGNESIUM ION
lig 38
MG
0
2956 1MAGNESIUM ION
lig 39
MG
0
2957 1MAGNESIUM ION
lig 40
MG
0
2958 1MAGNESIUM ION
lig 41
MG
0
2959 1MAGNESIUM ION
lig 42
MG
0
2960 1MAGNESIUM ION
lig 43
MG
0
2961 1MAGNESIUM ION
lig 44
MG
0
2962 1MAGNESIUM ION
lig 45
MG
0
2963 1MAGNESIUM ION
lig 46
MG
0
2964 1MAGNESIUM ION
lig 47
MG
0
2965 1MAGNESIUM ION
lig 48
MG
0
2966 1MAGNESIUM ION
lig 49
MG
0
2967 1MAGNESIUM ION
lig 50
MG
0
2968 1MAGNESIUM ION
lig 51
MG
0
2969 1MAGNESIUM ION
lig 52
MG
0
2970 1MAGNESIUM ION
lig 53
MG
0
2971 1MAGNESIUM ION
lig 54
MG
0
2972 1MAGNESIUM ION
lig 55
MG
0
2973 1MAGNESIUM ION
lig 56
MG
0
2974 1MAGNESIUM ION
lig 57
MG
0
2975 1MAGNESIUM ION
lig 58
MG
0
2976 1MAGNESIUM ION
lig 59
MG
0
2977 1MAGNESIUM ION
lig 60
MG
0
2978 1MAGNESIUM ION
lig 61
MG
0
2979 1MAGNESIUM ION
lig 62
MG
0
2980 1MAGNESIUM ION
lig 63
MG
0
2981 1MAGNESIUM ION
lig 64
MG
0
2982 1MAGNESIUM ION
lig 65
MG
0
2983 1MAGNESIUM ION
lig 66
MG
0
2984 1MAGNESIUM ION
lig 67
MG
0
2985 1MAGNESIUM ION
lig 68
MG
0
2986 1MAGNESIUM ION
lig 69
MG
0
2987 1MAGNESIUM ION
lig 70
MG
0
2988 1MAGNESIUM ION
lig 71
MG
0
2989 1MAGNESIUM ION
lig 72
MG
0
2990 1MAGNESIUM ION
lig 73
MG
0
2991 1MAGNESIUM ION
lig 74
MG
0
2992 1MAGNESIUM ION
lig 75
MG
0
2993 1MAGNESIUM ION
lig 76
MG
0
2994 1MAGNESIUM ION
lig 77
MG
0
2995 1MAGNESIUM ION
lig 78
MG
0
2996 1MAGNESIUM ION
lig 79
MG
0
2997 1MAGNESIUM ION
lig 80
MG
0
2998 1MAGNESIUM ION
lig 81
MG
0
2999 1MAGNESIUM ION
lig 82
MG
0
3000 1MAGNESIUM ION
lig 83
MG
0
3001 1MAGNESIUM ION
lig 84
MG
0
3002 1MAGNESIUM ION
lig 85
MG
0
3003 1MAGNESIUM ION
lig 86
MG
0
3004 1MAGNESIUM ION
lig 87
MG
0
3005 1MAGNESIUM ION
lig 88
MG
0
3006 1MAGNESIUM ION
lig 89
MG
0
3007 1MAGNESIUM ION
lig 90
MG
0
3008 1MAGNESIUM ION
lig 91
MG
0
3009 1MAGNESIUM ION
lig 92
MG
0
3010 1MAGNESIUM ION
lig 93
MG
0
3011 1MAGNESIUM ION
lig 94
MG
0
3012 1MAGNESIUM ION
lig 95
MG
0
3013 1MAGNESIUM ION
lig 96
MG
0
3014 1MAGNESIUM ION
lig 97
MG
0
3015 1MAGNESIUM ION
lig 98
MG
0
3016 1MAGNESIUM ION
lig 99
MG
0
3017 1MAGNESIUM ION
lig 100
MG
0
3018 1MAGNESIUM ION
lig 101
MG
0
3019 1MAGNESIUM ION
lig 102
MG
0
3020 1MAGNESIUM ION
lig 103
MG
0
3021 1MAGNESIUM ION
lig 104
MG
0
3022 1MAGNESIUM ION
lig 105
MG
0
3023 1MAGNESIUM ION
lig 106
MG
0
3024 1MAGNESIUM ION
lig 107
MG
0
3025 1MAGNESIUM ION
lig 108
MG
0
3026 1MAGNESIUM ION
lig 109
MG
0
3027 1MAGNESIUM ION
lig 110
MG
0
3028 1MAGNESIUM ION
lig 111
MG
0
3029 1MAGNESIUM ION
lig 112
MG
0
3030 1MAGNESIUM ION
lig 113
K
0
3031 1POTASSIUM ION
lig 114
NA
0
3032 1SODIUM ION
lig 115
NA
0
3033 1SODIUM ION
lig 116
NA
0
3034 1SODIUM ION
lig 117
NA
0
3035 1SODIUM ION
lig 118
NA
0
3036 1SODIUM ION
lig 119
NA
0
3037 1SODIUM ION
lig 120
NA
0
3038 1SODIUM ION
lig 121
NA
0
3039 1SODIUM ION
lig 122
NA
0
3040 1SODIUM ION
lig 123
NA
0
3041 1SODIUM ION
lig 124
NA
0
3042 1SODIUM ION
lig 125
NA
0
3043 1SODIUM ION
lig 126
NA
0
3044 1SODIUM ION
lig 127
NA
0
3045 1SODIUM ION
lig 128
NA
0
3046 1SODIUM ION
lig 129
NA
0
3047 1SODIUM ION
lig 130
NA
0
3048 1SODIUM ION
lig 131
NA
0
3049 1SODIUM ION
lig 132
NA
0
3050 1SODIUM ION
lig 133
NA
0
3051 1SODIUM ION
lig 134
NA
0
3052 1SODIUM ION
lig 135
NA
0
3053 1SODIUM ION
lig 136
NA
0
3054 1SODIUM ION
lig 137
NA
0
3055 1SODIUM ION
lig 138
NA
0
3056 1SODIUM ION
lig 139
NA
0
3057 1SODIUM ION
lig 140
NA
0
3058 1SODIUM ION
lig 141
NA
0
3059 1SODIUM ION
lig 142
NA
0
3060 1SODIUM ION
lig 143
NA
0
3061 1SODIUM ION
lig 144
NA
0
3062 1SODIUM ION
lig 145
NA
0
3063 1SODIUM ION
lig 146
NA
0
3064 1SODIUM ION
lig 147
NA
0
3065 1SODIUM ION
lig 148
NA
0
3066 1SODIUM ION
lig 149
NA
0
3067 1SODIUM ION
lig 150
NA
0
3068 1SODIUM ION
lig 151
NA
0
3069 1SODIUM ION
lig 152
NA
0
3070 1SODIUM ION
lig 153
NA
0
3071 1SODIUM ION
lig 154
NA
0
3072 1SODIUM ION
lig 155
NA
0
3073 1SODIUM ION
lig 156
NA
0
3074 1SODIUM ION
lig 157
NA
0
3075 1SODIUM ION
lig 158
NA
0
3076 1SODIUM ION
lig 159
NA
0
3077 1SODIUM ION
lig 160
NA
0
3078 1SODIUM ION
lig 161
NA
0
3079 1SODIUM ION
lig 162
NA
0
3080 1SODIUM ION
lig 163
NA
0
3081 1SODIUM ION
lig 164
NA
0
3082 1SODIUM ION
lig 165
NA
0
3083 1SODIUM ION
lig 166
NA
0
3084 1SODIUM ION
lig 167
NA
0
3085 1SODIUM ION
lig 168
NA
0
3086 1SODIUM ION
lig 169
NA
0
3087 1SODIUM ION
lig 170
NA
0
3088 1SODIUM ION
lig 171
NA
0
3089 1SODIUM ION
lig 172
NA
0
3090 1SODIUM ION
lig 173
NA
0
3091 1SODIUM ION
lig 174
NA
0
3092 1SODIUM ION
lig 175
NA
0
3093 1SODIUM ION
lig 176
NA
0
3094 1SODIUM ION
lig 177
NA
0
3095 1SODIUM ION
lig 178
NA
0
3096 1SODIUM ION
lig 179
NA
0
3097 1SODIUM ION
lig 180
NA
0
3098 1SODIUM ION
lig 181
NA
0
3099 1SODIUM ION
lig 182
NA
0
3100 1SODIUM ION
lig 183
NA
0
3101 1SODIUM ION
lig 184
NA
0
3102 1SODIUM ION
lig 185
NA
0
3103 1SODIUM ION
lig 186
NA
0
3104 1SODIUM ION
lig 187
CL
0
3105 1CHLORIDE ION
lig 188
CL
0
3106 1CHLORIDE ION
lig 189
CL
0
3107 1CHLORIDE ION
lig 190
CL
0
3108 1CHLORIDE ION
lig 191
CL
0
3109 1CHLORIDE ION
lig 192
CL
0
3110 1CHLORIDE ION
lig 193
CL
0
3111 1CHLORIDE ION
lig 194
CL
0
3112 1CHLORIDE ION
lig 195
MG
9
123 1MAGNESIUM ION
lig 196
NA
9
124 1SODIUM ION
lig 197
NA
9
125 1SODIUM ION
lig 198
NA
9
126 1SODIUM ION
lig 199
MG
A
240 1MAGNESIUM ION
lig 200
MG
A
241 1MAGNESIUM ION
lig 201
NA
A
242 1SODIUM ION
lig 202
CL
A
243 1CHLORIDE ION
lig 203
MG
B
338 1MAGNESIUM ION
lig 204
CL
B
339 1CHLORIDE ION
lig 205
NA
C
247 1SODIUM ION
lig 206
NA
H
172 1SODIUM ION
lig 207
NA
J
146 1SODIUM ION
lig 208
CL
J
147 1CHLORIDE ION
lig 209
CL
J
148 1CHLORIDE ION
lig 210
CL
J
149 1CHLORIDE ION
lig 211
MG
K
133 1MAGNESIUM ION
lig 212
CL
K
134 1CHLORIDE ION
lig 213
NA
L
165 1SODIUM ION
lig 214
CL
L
166 1CHLORIDE ION
lig 215
K
M
196 1POTASSIUM ION
lig 216
NA
M
197 1SODIUM ION
lig 217
CL
M
198 1CHLORIDE ION
lig 218
CL
N
187 1CHLORIDE ION
lig 219
CD
O
116 1CADMIUM ION
lig 220
CL
O
117 1CHLORIDE ION
lig 221
NA
Q
96 1SODIUM ION
lig 222
CL
Q
97 1CHLORIDE ION
lig 223
NA
R
155 1SODIUM ION
lig 224
NA
R
156 1SODIUM ION
lig 225
CL
R
157 1CHLORIDE ION
lig 226
NA
S
85 1SODIUM ION
lig 227
MG
T
120 1MAGNESIUM ION
lig 228
CD
U
67 1CADMIUM ION
lig 229
MG
Y
241 1MAGNESIUM ION
lig 230
CL
Y
242 1CHLORIDE ION
lig 231
CD
Z
93 1CADMIUM ION
lig 232
CD
1
57 1CADMIUM ION
lig 233
MG
3
93 1MAGNESIUM ION
lig 234
CD
3
94 1CADMIUM ION
lig 235
CL
3
95 1CHLORIDE ION