Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2VC7


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 69 ligands in PDB entry 2VC7. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
KCX
A
137 12LYSINE NZ-CARBOXYLIC ACID
lig 2
KCX
B
137 12LYSINE NZ-CARBOXYLIC ACID
lig 3
KCX
C
137 12LYSINE NZ-CARBOXYLIC ACID
lig 4
KCX
D
137 12LYSINE NZ-CARBOXYLIC ACID
lig 5
FE2
A
1315 1FE (II) ION
lig 6
CO
A
1316 1COBALT (II) ION
lig 7
GOL
A
1317 6GLYCEROL
lig 8
EDO
A
1318 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
GOL
A
1319 6GLYCEROL
lig 10
EDO
A
1320 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
GOL
A
1321 6GLYCEROL
lig 12
EDO
A
1322 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
GOL
A
1323 6GLYCEROL
lig 14
GOL
A
1324 6GLYCEROL
lig 15
GOL
A
1325 6GLYCEROL
lig 16
GOL
A
1326 6GLYCEROL
lig 17
EDO
A
1327 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
GOL
A
1328 6GLYCEROL
lig 19
GOL
A
1329 6GLYCEROL
lig 20
EDO
A
1330 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
1331 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
GOL
A
1332 6GLYCEROL
lig 23
GOL
A
1333 6GLYCEROL
lig 24
GOL
A
1334 6GLYCEROL
lig 25
HT5
A
1335 18 THIOPHENIUM
lig 26
FE2
B
1315 1FE (II) ION
lig 27
CO
B
1316 1COBALT (II) ION
lig 28
GOL
B
1317 6GLYCEROL
lig 29
EDO
B
1318 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
B
1319 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
B
1320 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
GOL
B
1321 6GLYCEROL
lig 33
GOL
B
1322 6GLYCEROL
lig 34
GOL
B
1323 6GLYCEROL
lig 35
EDO
B
1324 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
GOL
B
1325 6GLYCEROL
lig 37
EDO
B
1326 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
GOL
B
1327 6GLYCEROL
lig 39
HT5
B
1328 18 THIOPHENIUM
lig 40
FE2
C
1315 1FE (II) ION
lig 41
CO
C
1316 1COBALT (II) ION
lig 42
GOL
C
1317 6GLYCEROL
lig 43
EDO
C
1318 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
GOL
C
1319 6GLYCEROL
lig 45
GOL
C
1320 6GLYCEROL
lig 46
EDO
C
1321 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
C
1322 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
C
1323 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
GOL
C
1324 6GLYCEROL
lig 50
GOL
C
1325 6GLYCEROL
lig 51
EDO
C
1326 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
GOL
C
1327 6GLYCEROL
lig 53
EDO
C
1328 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
HT5
C
1329 18 THIOPHENIUM
lig 55
FE2
D
1315 1FE (II) ION
lig 56
CO
D
1316 1COBALT (II) ION
lig 57
GOL
D
1317 6GLYCEROL
lig 58
EDO
D
1318 41,2-ETHANEDIOL
lig 59
EDO
D
1319 41,2-ETHANEDIOL
lig 60
GOL
D
1320 6GLYCEROL
lig 61
GOL
D
1321 6GLYCEROL
lig 62
EDO
D
1322 41,2-ETHANEDIOL
lig 63
EDO
D
1323 41,2-ETHANEDIOL
lig 64
GOL
D
1324 6GLYCEROL
lig 65
EDO
D
1325 41,2-ETHANEDIOL
lig 66
EDO
D
1326 41,2-ETHANEDIOL
lig 67
EDO
D
1327 41,2-ETHANEDIOL
lig 68
EDO
D
1328 41,2-ETHANEDIOL
lig 69
HT5
D
1329 18 THIOPHENIUM