Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2VJX


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 67 ligands in PDB entry 2VJX. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
IFL
A
1865 11 ONE
lig 2
EDO
A
1866 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
1867 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
1868 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
1869 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
1876 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
1877 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
1878 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
1879 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
1880 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
1881 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
1882 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
1883 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
1884 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
1885 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
A
1886 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
A
1887 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
1888 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
A
1889 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
A
1890 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
BR
A
1891 1BROMIDE ION
lig 28
BR
A
1892 1BROMIDE ION
lig 29
BR
A
1893 1BROMIDE ION
lig 30
BR
A
1894 1BROMIDE ION
lig 31
CL
A
1895 1CHLORIDE ION
lig 32
CL
A
1896 1CHLORIDE ION
lig 33
CL
A
1897 1CHLORIDE ION
lig 34
CL
A
1898 1CHLORIDE ION
lig 35
BR
A
1899 1BROMIDE ION
lig 36
CL
A
1900 1CHLORIDE ION
lig 37
CL
A
1901 1CHLORIDE ION
lig 38
IFL
B
1867 11 ONE
lig 39
EDO
B
1868 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
B
1869 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
B
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
B
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
B
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
B
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
B
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
B
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
B
1876 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
B
1877 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
B
1878 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
B
1879 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
B
1880 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
B
1881 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
B
1882 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
B
1883 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
EDO
B
1884 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
EDO
B
1885 41,2-ETHANEDIOL
lig 57
BR
B
1886 1BROMIDE ION
lig 58
BR
B
1887 1BROMIDE ION
lig 59
CL
B
1888 1CHLORIDE ION
lig 60
CL
B
1889 1CHLORIDE ION
lig 61
CL
B
1890 1CHLORIDE ION
lig 62
CL
B
1891 1CHLORIDE ION
lig 63
EDO
B
1892 41,2-ETHANEDIOL
lig 64
EDO
B
1893 41,2-ETHANEDIOL
lig 65
EDO
B
1894 41,2-ETHANEDIOL
lig 66
CL
B
1895 1CHLORIDE ION
lig 67
CL
B
1896 1CHLORIDE ION