Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2VL4


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 54 ligands in PDB entry 2VL4. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
MNM
A
1865 11 PIPERIDINE
lig 2
EDO
A
1866 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
1867 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
1868 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
1869 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
1876 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
1877 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
BR
A
1878 1BROMIDE ION
lig 15
BR
A
1879 1BROMIDE ION
lig 16
BR
A
1880 1BROMIDE ION
lig 17
BR
A
1881 1BROMIDE ION
lig 18
BR
A
1882 1BROMIDE ION
lig 19
BR
A
1883 1BROMIDE ION
lig 20
EDO
A
1884 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
CL
A
1885 1CHLORIDE ION
lig 22
BR
A
1886 1BROMIDE ION
lig 23
EDO
A
1887 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
1888 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
CL
A
1889 1CHLORIDE ION
lig 26
MNM
B
1868 11 PIPERIDINE
lig 27
EDO
B
1869 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
B
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
B
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
B
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
B
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
B
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
B
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
B
1876 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
B
1877 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
B
1878 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
B
1879 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
B
1880 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
B
1881 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
B
1882 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
B
1883 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
BR
B
1884 1BROMIDE ION
lig 43
BR
B
1885 1BROMIDE ION
lig 44
BR
B
1886 1BROMIDE ION
lig 45
BR
B
1887 1BROMIDE ION
lig 46
EDO
B
1888 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
CL
B
1889 1CHLORIDE ION
lig 48
EDO
B
1890 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
B
1891 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
B
1892 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
B
1893 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
CL
B
1894 1CHLORIDE ION
lig 53
EDO
B
1895 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
CL
B
1896 1CHLORIDE ION