Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2VMF


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 69 ligands in PDB entry 2VMF. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
MVL
A
1865 14 TETRAHYDROIMIDAZO[1,2-A]PYRIDINE-6,7,8-TR
lig 2
EDO
A
1866 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
1867 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
1868 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
1869 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
1876 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
1877 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
1878 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
1879 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
1880 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
BR
A
1881 1BROMIDE ION
lig 18
BR
A
1882 1BROMIDE ION
lig 19
BR
A
1883 1BROMIDE ION
lig 20
BR
A
1884 1BROMIDE ION
lig 21
BR
A
1885 1BROMIDE ION
lig 22
BR
A
1886 1BROMIDE ION
lig 23
CL
A
1887 1CHLORIDE ION
lig 24
EDO
A
1888 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
BR
A
1889 1BROMIDE ION
lig 26
BR
A
1890 1BROMIDE ION
lig 27
CL
A
1891 1CHLORIDE ION
lig 28
EDO
A
1892 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
A
1893 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
BR
A
1894 1BROMIDE ION
lig 31
EDO
A
1895 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
A
1896 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
CL
A
1897 1CHLORIDE ION
lig 34
CL
A
1898 1CHLORIDE ION
lig 35
EDO
A
1899 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
MVL
B
1868 14 TETRAHYDROIMIDAZO[1,2-A]PYRIDINE-6,7,8-TR
lig 37
EDO
B
1869 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
B
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
B
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
B
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
B
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
B
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
B
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
B
1876 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
B
1877 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
B
1878 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
BR
B
1879 1BROMIDE ION
lig 48
BR
B
1880 1BROMIDE ION
lig 49
BR
B
1881 1BROMIDE ION
lig 50
BR
B
1882 1BROMIDE ION
lig 51
CL
B
1883 1CHLORIDE ION
lig 52
CL
B
1884 1CHLORIDE ION
lig 53
CL
B
1885 1CHLORIDE ION
lig 54
CL
B
1886 1CHLORIDE ION
lig 55
BR
B
1887 1BROMIDE ION
lig 56
EDO
B
1888 41,2-ETHANEDIOL
lig 57
EDO
B
1889 41,2-ETHANEDIOL
lig 58
EDO
B
1890 41,2-ETHANEDIOL
lig 59
BR
B
1891 1BROMIDE ION
lig 60
CL
B
1892 1CHLORIDE ION
lig 61
CL
B
1893 1CHLORIDE ION
lig 62
EDO
B
1894 41,2-ETHANEDIOL
lig 63
EDO
B
1895 41,2-ETHANEDIOL
lig 64
EDO
B
1896 41,2-ETHANEDIOL
lig 65
CL
B
1897 1CHLORIDE ION
lig 66
EDO
B
1898 41,2-ETHANEDIOL
lig 67
EDO
B
1899 41,2-ETHANEDIOL
lig 68
EDO
B
1900 41,2-ETHANEDIOL
lig 69
BR
B
1901 1BROMIDE ION