Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2VQT


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 70 ligands in PDB entry 2VQT. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
15A
A
1865 15 (HYDROXYMETHYL)PIPERIDINE-3,4,5-TRIOL
lig 2
EDO
A
1866 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
1867 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
1868 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
1869 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
1876 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
1877 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
1878 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
1879 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
1880 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
1881 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
BR
A
1882 1BROMIDE ION
lig 19
BR
A
1883 1BROMIDE ION
lig 20
BR
A
1884 1BROMIDE ION
lig 21
BR
A
1885 1BROMIDE ION
lig 22
CL
A
1886 1CHLORIDE ION
lig 23
CL
A
1887 1CHLORIDE ION
lig 24
CL
A
1888 1CHLORIDE ION
lig 25
CL
A
1889 1CHLORIDE ION
lig 26
EDO
A
1890 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
A
1891 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
CL
A
1892 1CHLORIDE ION
lig 29
EDO
A
1893 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
BR
A
1894 1BROMIDE ION
lig 31
CL
A
1895 1CHLORIDE ION
lig 32
BR
A
1896 1BROMIDE ION
lig 33
CL
A
1897 1CHLORIDE ION
lig 34
CL
A
1898 1CHLORIDE ION
lig 35
15A
B
1867 15 (HYDROXYMETHYL)PIPERIDINE-3,4,5-TRIOL
lig 36
EDO
B
1868 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
B
1869 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
B
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
B
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
B
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
B
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
B
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
B
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
B
1876 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
B
1877 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
B
1878 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
B
1879 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
B
1880 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
B
1881 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
B
1882 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
B
1883 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
B
1884 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
BR
B
1885 1BROMIDE ION
lig 54
BR
B
1886 1BROMIDE ION
lig 55
BR
B
1887 1BROMIDE ION
lig 56
CL
B
1888 1CHLORIDE ION
lig 57
CL
B
1889 1CHLORIDE ION
lig 58
CL
B
1890 1CHLORIDE ION
lig 59
EDO
B
1891 41,2-ETHANEDIOL
lig 60
EDO
B
1892 41,2-ETHANEDIOL
lig 61
EDO
B
1893 41,2-ETHANEDIOL
lig 62
BR
B
1894 1BROMIDE ION
lig 63
EDO
B
1895 41,2-ETHANEDIOL
lig 64
EDO
B
1896 41,2-ETHANEDIOL
lig 65
CL
B
1897 1CHLORIDE ION
lig 66
CL
B
1898 1CHLORIDE ION
lig 67
EDO
B
1899 41,2-ETHANEDIOL
lig 68
EDO
B
1900 41,2-ETHANEDIOL
lig 69
EDO
B
1901 41,2-ETHANEDIOL
lig 70
EDO
B
1902 41,2-ETHANEDIOL