Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2VR4


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 71 ligands in PDB entry 2VR4. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
17B
A
1865 17 (HYDROXYMETHYL)PIPERIDINE-3,4,5-TRIOL
lig 2
EDO
A
1866 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
1867 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
1868 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
1869 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
BR
A
1877 1BROMIDE ION
lig 13
BR
A
1878 1BROMIDE ION
lig 14
BR
A
1879 1BROMIDE ION
lig 15
CL
A
1880 1CHLORIDE ION
lig 16
EDO
A
1881 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
BR
A
1882 1BROMIDE ION
lig 18
EDO
A
1883 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
BR
A
1884 1BROMIDE ION
lig 20
EDO
A
1885 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
1886 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
CL
A
1887 1CHLORIDE ION
lig 23
EDO
A
1888 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
1889 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
CL
A
1890 1CHLORIDE ION
lig 26
BR
A
1891 1BROMIDE ION
lig 27
CL
A
1892 1CHLORIDE ION
lig 28
EDO
A
1893 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
A
1894 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
A
1895 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
A
1896 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
CL
A
1897 1CHLORIDE ION
lig 33
EDO
A
1898 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
17B
B
1869 17 (HYDROXYMETHYL)PIPERIDINE-3,4,5-TRIOL
lig 35
EDO
B
1870 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
B
1871 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
B
1872 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
B
1873 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
B
1874 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
B
1875 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
B
1876 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
B
1877 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
B
1878 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
B
1879 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
B
1880 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
B
1881 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
B
1882 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
CL
B
1883 1CHLORIDE ION
lig 49
BR
B
1884 1BROMIDE ION
lig 50
BR
B
1885 1BROMIDE ION
lig 51
EDO
B
1886 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
B
1887 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
B
1889 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
CL
B
1891 1CHLORIDE ION
lig 55
EDO
B
1892 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
CL
B
1894 1CHLORIDE ION
lig 57
EDO
B
1896 41,2-ETHANEDIOL
lig 58
EDO
B
1897 41,2-ETHANEDIOL
lig 59
EDO
B
1898 41,2-ETHANEDIOL
lig 60
EDO
B
1899 41,2-ETHANEDIOL
lig 61
EDO
B
1900 41,2-ETHANEDIOL
lig 62
CL
B
1901 1CHLORIDE ION
lig 63
CL
B
1902 1CHLORIDE ION
lig 64
EDO
B
1903 41,2-ETHANEDIOL
lig 65
CL
B
1904 1CHLORIDE ION
lig 66
EDO
B
1905 41,2-ETHANEDIOL
lig 67
EDO
B
1906 41,2-ETHANEDIOL
lig 68
EDO
B
1907 41,2-ETHANEDIOL
lig 69
EDO
B
1908 41,2-ETHANEDIOL
lig 70
EDO
B
1909 41,2-ETHANEDIOL
lig 71
EDO
B
1910 41,2-ETHANEDIOL