Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
2YFO


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 34 ligands in PDB entry 2YFO. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
GOL
A
1722 6GLYCEROL
lig 2
PGE
A
1723 4TRIETHYLENE GLYCOL
lig 3
PGE
A
1724 4TRIETHYLENE GLYCOL
lig 4
PGE
A
1725 4TRIETHYLENE GLYCOL
lig 5
PGE
A
1726 4TRIETHYLENE GLYCOL
lig 6
PO4
A
1727 5PHOSPHATE ION
lig 7
NA
A
1728 1SODIUM ION
lig 8
NA
A
1729 1SODIUM ION
lig 9
NA
A
1730 1SODIUM ION
lig 10
NA
A
1731 1SODIUM ION
lig 11
NA
A
1732 1SODIUM ION
lig 12
NA
A
1733 1SODIUM ION
lig 13
NA
A
1734 1SODIUM ION
lig 14
NA
A
1735 1SODIUM ION
lig 15
NA
A
1736 1SODIUM ION
lig 16
NA
A
1737 1SODIUM ION
lig 17
NA
A
1738 1SODIUM ION
lig 18
NA
A
1739 1SODIUM ION
lig 19
NA
A
1740 1SODIUM ION
lig 20
NA
A
1741 1SODIUM ION
lig 21
NA
A
1742 1SODIUM ION
lig 22
NA
A
1743 1SODIUM ION
lig 23
NA
A
1744 1SODIUM ION
lig 24
NA
A
1745 1SODIUM ION
lig 25
NA
A
1746 1SODIUM ION
lig 26
NA
A
1747 1SODIUM ION
lig 27
NA
A
1748 1SODIUM ION
lig 28
NA
A
1749 1SODIUM ION
lig 29
NA
A
1750 1SODIUM ION
lig 30
NA
A
1751 1SODIUM ION
lig 31
NA
A
1752 1SODIUM ION
lig 32
NA
A
1753 1SODIUM ION
lig 33
NA
A
1754 1SODIUM ION
lig 34
GLA
A
1755 12ALPHA-D-GALACTOPYRANOSE