Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3AMO


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 103 ligands in PDB entry 3AMO. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
1TY
A
382 22 IMINO]CYCLOHEXA-1,4-DIEN-1-YL}ALANINE
lig 2
2TY
B
382 222-HYDROXY-5-{[(1E)-2-PHENYLETHYLIDENE]AMIN
lig 3
CU
A
701 1COPPER (II) ION
lig 4
NA
A
703 1SODIUM ION
lig 5
GOL
A
639 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
640 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
641 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
642 6GLYCEROL
lig 9
GOL
A
643 6GLYCEROL
lig 10
GOL
A
644 6GLYCEROL
lig 11
GOL
A
645 6GLYCEROL
lig 12
GOL
A
646 6GLYCEROL
lig 13
GOL
A
647 6GLYCEROL
lig 14
GOL
A
648 6GLYCEROL
lig 15
GOL
A
649 6GLYCEROL
lig 16
GOL
A
650 6GLYCEROL
lig 17
GOL
A
651 6GLYCEROL
lig 18
GOL
A
652 6GLYCEROL
lig 19
GOL
A
653 6GLYCEROL
lig 20
GOL
A
654 6GLYCEROL
lig 21
GOL
A
655 6GLYCEROL
lig 22
GOL
A
656 6GLYCEROL
lig 23
GOL
A
657 6GLYCEROL
lig 24
GOL
A
658 6GLYCEROL
lig 25
GOL
A
659 6GLYCEROL
lig 26
GOL
A
660 6GLYCEROL
lig 27
GOL
A
661 6GLYCEROL
lig 28
GOL
A
662 6GLYCEROL
lig 29
GOL
A
663 6GLYCEROL
lig 30
GOL
A
664 6GLYCEROL
lig 31
GOL
A
665 6GLYCEROL
lig 32
GOL
A
666 6GLYCEROL
lig 33
GOL
A
667 6GLYCEROL
lig 34
GOL
A
668 6GLYCEROL
lig 35
GOL
A
669 6GLYCEROL
lig 36
GOL
A
670 6GLYCEROL
lig 37
GOL
A
671 6GLYCEROL
lig 38
GOL
A
672 6GLYCEROL
lig 39
GOL
A
673 6GLYCEROL
lig 40
GOL
A
674 6GLYCEROL
lig 41
GOL
A
675 6GLYCEROL
lig 42
GOL
A
676 6GLYCEROL
lig 43
GOL
A
677 6GLYCEROL
lig 44
GOL
A
678 6GLYCEROL
lig 45
GOL
A
679 6GLYCEROL
lig 46
GOL
A
680 6GLYCEROL
lig 47
GOL
A
681 6GLYCEROL
lig 48
GOL
A
682 6GLYCEROL
lig 49
GOL
A
683 6GLYCEROL
lig 50
GOL
A
684 6GLYCEROL
lig 51
GOL
A
685 6GLYCEROL
lig 52
GOL
A
686 6GLYCEROL
lig 53
CU
B
701 1COPPER (II) ION
lig 54
NA
B
703 1SODIUM ION
lig 55
GOL
B
639 6GLYCEROL
lig 56
GOL
B
640 6GLYCEROL
lig 57
GOL
B
641 6GLYCEROL
lig 58
GOL
B
642 6GLYCEROL
lig 59
GOL
B
643 6GLYCEROL
lig 60
GOL
B
644 6GLYCEROL
lig 61
GOL
B
645 6GLYCEROL
lig 62
GOL
B
646 6GLYCEROL
lig 63
GOL
B
647 6GLYCEROL
lig 64
GOL
B
648 6GLYCEROL
lig 65
GOL
B
649 6GLYCEROL
lig 66
GOL
B
650 6GLYCEROL
lig 67
GOL
B
651 6GLYCEROL
lig 68
GOL
B
652 6GLYCEROL
lig 69
GOL
B
653 6GLYCEROL
lig 70
GOL
B
654 6GLYCEROL
lig 71
GOL
B
655 6GLYCEROL
lig 72
GOL
B
656 6GLYCEROL
lig 73
GOL
B
657 6GLYCEROL
lig 74
GOL
B
658 6GLYCEROL
lig 75
GOL
B
659 6GLYCEROL
lig 76
GOL
B
660 6GLYCEROL
lig 77
GOL
B
661 6GLYCEROL
lig 78
GOL
B
662 6GLYCEROL
lig 79
GOL
B
663 6GLYCEROL
lig 80
GOL
B
664 6GLYCEROL
lig 81
GOL
B
665 6GLYCEROL
lig 82
GOL
B
666 6GLYCEROL
lig 83
GOL
B
667 6GLYCEROL
lig 84
GOL
B
668 6GLYCEROL
lig 85
GOL
B
669 6GLYCEROL
lig 86
GOL
B
670 6GLYCEROL
lig 87
GOL
B
671 6GLYCEROL
lig 88
GOL
B
672 6GLYCEROL
lig 89
GOL
B
673 6GLYCEROL
lig 90
GOL
B
674 6GLYCEROL
lig 91
GOL
B
675 6GLYCEROL
lig 92
GOL
B
676 6GLYCEROL
lig 93
GOL
B
677 6GLYCEROL
lig 94
GOL
B
678 6GLYCEROL
lig 95
GOL
B
679 6GLYCEROL
lig 96
GOL
B
680 6GLYCEROL
lig 97
GOL
B
681 6GLYCEROL
lig 98
GOL
B
682 6GLYCEROL
lig 99
GOL
B
683 6GLYCEROL
lig 100
GOL
B
684 6GLYCEROL
lig 101
GOL
B
685 6GLYCEROL
lig 102
GOL
B
686 6GLYCEROL
lig 103
GOL
B
687 6GLYCEROL