Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3CMA


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 312 ligands in PDB entry 3CMA. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
1MA
0
628 236-HYDRO-1-METHYLADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE
lig 2
OMU
0
2587 21O2'-METHYLURIDINE 5'-MONOPHOSPHATE
lig 3
OMG
0
2588 24O2'-METHYLGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE
lig 4
UR3
0
2619 213-METHYLURIDINE-5'-MONOPHOSHATE
lig 5
PSU
0
2621 20PSEUDOURIDINE-5'-MONOPHOSPHATE
lig 6
8AN
6
76 223'-AMINO-3'-DEOXYADENOSINE 5'-(DIHYDROGEN
lig 7
MG
A
8025 1MAGNESIUM ION
lig 8
MG
A
8051 1MAGNESIUM ION
lig 9
CL
A
8809 1CHLORIDE ION
lig 10
SR
A
8929 1STRONTIUM ION
lig 11
SR
A
8930 1STRONTIUM ION
lig 12
SR
A
8977 1STRONTIUM ION
lig 13
NA
B
8552 1SODIUM ION
lig 14
MG
B
8042 1MAGNESIUM ION
lig 15
CL
B
8819 1CHLORIDE ION
lig 16
SR
B
8950 1STRONTIUM ION
lig 17
SR
B
8987 1STRONTIUM ION
lig 18
MG
C
8012 1MAGNESIUM ION
lig 19
NA
C
8503 1SODIUM ION
lig 20
NA
D
8543 1SODIUM ION
lig 21
SR
F
9005 1STRONTIUM ION
lig 22
SR
H
8907 1STRONTIUM ION
lig 23
SR
H
8972 1STRONTIUM ION
lig 24
NA
J
8538 1SODIUM ION
lig 25
CL
J
8801 1CHLORIDE ION
lig 26
CL
J
8802 1CHLORIDE ION
lig 27
CL
J
8821 1CHLORIDE ION
lig 28
MG
K
8054 1MAGNESIUM ION
lig 29
CL
K
8812 1CHLORIDE ION
lig 30
NA
L
8568 1SODIUM ION
lig 31
CL
L
8814 1CHLORIDE ION
lig 32
CL
L
8810 1CHLORIDE ION
lig 33
NA
M
8539 1SODIUM ION
lig 34
CL
M
8818 1CHLORIDE ION
lig 35
CL
N
8807 1CHLORIDE ION
lig 36
CD
O
8705 1CADMIUM ION
lig 37
CL
O
8808 1CHLORIDE ION
lig 38
CL
Q
8811 1CHLORIDE ION
lig 39
NA
Q
8540 1SODIUM ION
lig 40
NA
R
8533 1SODIUM ION
lig 41
NA
R
8532 1SODIUM ION
lig 42
CL
R
8806 1CHLORIDE ION
lig 43
SR
R
8912 1STRONTIUM ION
lig 44
SR
S
8961 1STRONTIUM ION
lig 45
NA
S
8510 1SODIUM ION
lig 46
SR
T
8911 1STRONTIUM ION
lig 47
MG
T
8057 1MAGNESIUM ION
lig 48
SR
T
8939 1STRONTIUM ION
lig 49
CD
U
8701 1CADMIUM ION
lig 50
SR
Y
9002 1STRONTIUM ION
lig 51
MG
Y
8086 1MAGNESIUM ION
lig 52
CL
Y
8820 1CHLORIDE ION
lig 53
CD
Z
8703 1CADMIUM ION
lig 54
CD
1
8702 1CADMIUM ION
lig 55
SR
1
8913 1STRONTIUM ION
lig 56
SR
1
8952 1STRONTIUM ION
lig 57
CL
2
8803 1CHLORIDE ION
lig 58
MG
2
8060 1MAGNESIUM ION
lig 59
SR
3
8953 1STRONTIUM ION
lig 60
CD
3
8704 1CADMIUM ION
lig 61
CL
3
8804 1CHLORIDE ION
lig 62
SR
3
8932 1STRONTIUM ION
lig 63
SR
3
8999 1STRONTIUM ION
lig 64
MG
0
8001 1MAGNESIUM ION
lig 65
MG
0
8002 1MAGNESIUM ION
lig 66
MG
0
8003 1MAGNESIUM ION
lig 67
MG
0
8004 1MAGNESIUM ION
lig 68
MG
0
8005 1MAGNESIUM ION
lig 69
MG
0
8006 1MAGNESIUM ION
lig 70
MG
0
8007 1MAGNESIUM ION
lig 71
MG
0
8008 1MAGNESIUM ION
lig 72
MG
0
8009 1MAGNESIUM ION
lig 73
MG
0
8010 1MAGNESIUM ION
lig 74
MG
0
8011 1MAGNESIUM ION
lig 75
MG
0
8013 1MAGNESIUM ION
lig 76
MG
0
8014 1MAGNESIUM ION
lig 77
MG
0
8015 1MAGNESIUM ION
lig 78
MG
0
8016 1MAGNESIUM ION
lig 79
MG
0
8017 1MAGNESIUM ION
lig 80
MG
0
8018 1MAGNESIUM ION
lig 81
MG
0
8019 1MAGNESIUM ION
lig 82
MG
0
8020 1MAGNESIUM ION
lig 83
MG
0
8021 1MAGNESIUM ION
lig 84
MG
0
8022 1MAGNESIUM ION
lig 85
MG
0
8023 1MAGNESIUM ION
lig 86
MG
0
8024 1MAGNESIUM ION
lig 87
MG
0
8026 1MAGNESIUM ION
lig 88
MG
0
8027 1MAGNESIUM ION
lig 89
MG
0
8028 1MAGNESIUM ION
lig 90
MG
0
8029 1MAGNESIUM ION
lig 91
MG
0
8030 1MAGNESIUM ION
lig 92
MG
0
8031 1MAGNESIUM ION
lig 93
MG
0
8032 1MAGNESIUM ION
lig 94
MG
0
8033 1MAGNESIUM ION
lig 95
MG
0
8034 1MAGNESIUM ION
lig 96
MG
0
8035 1MAGNESIUM ION
lig 97
MG
0
8036 1MAGNESIUM ION
lig 98
MG
0
8037 1MAGNESIUM ION
lig 99
MG
0
8038 1MAGNESIUM ION
lig 100
MG
0
8039 1MAGNESIUM ION
lig 101
MG
0
8040 1MAGNESIUM ION
lig 102
MG
0
8041 1MAGNESIUM ION
lig 103
MG
0
8043 1MAGNESIUM ION
lig 104
MG
0
8044 1MAGNESIUM ION
lig 105
MG
0
8045 1MAGNESIUM ION
lig 106
MG
0
8046 1MAGNESIUM ION
lig 107
MG
0
8047 1MAGNESIUM ION
lig 108
MG
0
8048 1MAGNESIUM ION
lig 109
MG
0
8049 1MAGNESIUM ION
lig 110
MG
0
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MG
0
8052 1MAGNESIUM ION
lig 112
MG
0
8053 1MAGNESIUM ION
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MG
0
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lig 114
MG
0
8056 1MAGNESIUM ION
lig 115
MG
0
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lig 116
MG
0
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lig 117
MG
0
8061 1MAGNESIUM ION
lig 118
MG
0
8062 1MAGNESIUM ION
lig 119
MG
0
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lig 120
MG
0
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lig 121
MG
0
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lig 122
MG
0
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lig 123
MG
0
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MG
0
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MG
0
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MG
0
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lig 127
MG
0
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lig 128
MG
0
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MG
0
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MG
0
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MG
0
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MG
0
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MG
0
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lig 134
MG
0
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MG
0
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lig 136
MG
0
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lig 137
MG
0
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lig 138
MG
0
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lig 139
MG
0
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lig 140
MG
0
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lig 141
MG
0
8087 1MAGNESIUM ION
lig 142
MG
0
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lig 143
MG
0
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lig 144
MG
0
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lig 145
MG
0
8091 1MAGNESIUM ION
lig 146
MG
0
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lig 147
MG
0
8093 1MAGNESIUM ION
lig 148
K
0
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lig 149
K
0
8402 1POTASSIUM ION
lig 150
NA
0
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lig 151
NA
0
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lig 152
NA
0
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NA
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lig 154
NA
0
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lig 155
NA
0
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lig 156
NA
0
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lig 157
NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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lig 163
NA
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8516 1SODIUM ION
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NA
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lig 165
NA
0
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lig 166
NA
0
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lig 167
NA
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lig 168
NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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8537 1SODIUM ION
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NA
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NA
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NA
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lig 186
NA
0
8545 1SODIUM ION
lig 187
NA
0
8546 1SODIUM ION
lig 188
NA
0
8547 1SODIUM ION
lig 189
NA
0
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NA
0
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lig 191
NA
0
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lig 192
NA
0
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lig 193
NA
0
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lig 194
NA
0
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lig 195
NA
0
8555 1SODIUM ION
lig 196
NA
0
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lig 197
NA
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8557 1SODIUM ION
lig 198
NA
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NA
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lig 200
NA
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NA
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8561 1SODIUM ION
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NA
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NA
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lig 204
NA
0
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NA
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8565 1SODIUM ION
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NA
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NA
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8567 1SODIUM ION
lig 208
NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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NA
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CL
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lig 215
CL
0
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CL
0
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CL
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CL
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SR
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SR
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SR
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SR
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SR
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SR
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SR
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SR
0
9001 1STRONTIUM ION
lig 302
SR
0
9004 1STRONTIUM ION
lig 303
SR
0
9006 1STRONTIUM ION
lig 304
SR
0
9007 1STRONTIUM ION
lig 305
SR
0
9008 1STRONTIUM ION
lig 306
MG
9
8074 1MAGNESIUM ION
lig 307
NA
9
8572 1SODIUM ION
lig 308
SR
9
8968 1STRONTIUM ION
lig 309
SR
9
8980 1STRONTIUM ION
lig 310
SR
9
9003 1STRONTIUM ION
lig 311
PHE
6
77 11PHENYLALANINE
lig 312
ACA
6
78 86-AMINOHEXANOIC ACID