Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3DIL


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 39 ligands in PDB entry 3DIL. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
CCC
A
174 23CYTIDINE-5'-PHOSPHATE-2',3'-CYCLIC PHOSPHA
lig 2
LYS
A
175 10LYSINE
lig 3
K
A
200 1POTASSIUM ION
lig 4
NA
A
812 1SODIUM ION
lig 5
NA
A
201 1SODIUM ION
lig 6
NA
A
202 1SODIUM ION
lig 7
NA
A
203 1SODIUM ION
lig 8
NA
A
204 1SODIUM ION
lig 9
NA
A
205 1SODIUM ION
lig 10
NA
A
206 1SODIUM ION
lig 11
NA
A
207 1SODIUM ION
lig 12
NA
A
208 1SODIUM ION
lig 13
NA
A
209 1SODIUM ION
lig 14
NA
A
210 1SODIUM ION
lig 15
NA
A
211 1SODIUM ION
lig 16
NA
A
212 1SODIUM ION
lig 17
NA
A
213 1SODIUM ION
lig 18
NA
A
214 1SODIUM ION
lig 19
NA
A
215 1SODIUM ION
lig 20
NA
A
216 1SODIUM ION
lig 21
NA
A
217 1SODIUM ION
lig 22
NA
A
218 1SODIUM ION
lig 23
NA
A
219 1SODIUM ION
lig 24
NA
A
220 1SODIUM ION
lig 25
NA
A
221 1SODIUM ION
lig 26
NA
A
222 1SODIUM ION
lig 27
NA
A
223 1SODIUM ION
lig 28
NA
A
224 1SODIUM ION
lig 29
NA
A
225 1SODIUM ION
lig 30
NA
A
226 1SODIUM ION
lig 31
NA
A
227 1SODIUM ION
lig 32
NA
A
228 1SODIUM ION
lig 33
MG
A
229 1MAGNESIUM ION
lig 34
K
A
230 1POTASSIUM ION
lig 35
K
A
231 1POTASSIUM ION
lig 36
1PE
A
250 3PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 37
1PE
A
251 3PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 38
1PE
A
252 5PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 39
IPA
A
253 4ISOPROPYL ALCOHOL