Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3IWK


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 44 ligands in PDB entry 3IWK. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
NA
A
504 1SODIUM ION
lig 2
NAD
A
505 44NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
lig 3
NA
B
504 1SODIUM ION
lig 4
NAD
B
505 44NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
lig 5
GOL
B
2001 6GLYCEROL
lig 6
GOL
B
2002 6GLYCEROL
lig 7
NA
C
504 1SODIUM ION
lig 8
NAD
C
505 44NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
lig 9
GOL
C
2003 6GLYCEROL
lig 10
NA
D
504 1SODIUM ION
lig 11
NAD
D
505 27NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
lig 12
MRD
D
2004 8(4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL
lig 13
NA
E
504 1SODIUM ION
lig 14
NAD
E
505 44NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
lig 15
NA
F
504 1SODIUM ION
lig 16
NAD
F
505 44NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
lig 17
GOL
F
2006 6GLYCEROL
lig 18
NA
G
504 1SODIUM ION
lig 19
NAD
G
505 44NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
lig 20
GOL
G
2007 6GLYCEROL
lig 21
GOL
G
2009 6GLYCEROL
lig 22
GOL
G
2011 6GLYCEROL
lig 23
NA
H
504 1SODIUM ION
lig 24
NAD
H
505 44NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
lig 25
GOL
H
2010 6GLYCEROL
lig 26
NA
I
504 1SODIUM ION
lig 27
NAD
I
505 44NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
lig 28
GOL
I
2012 6GLYCEROL
lig 29
NA
J
504 1SODIUM ION
lig 30
NAD
J
505 44NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
lig 31
GOL
J
2013 6GLYCEROL
lig 32
GOL
J
2014 6GLYCEROL
lig 33
NA
K
504 1SODIUM ION
lig 34
NAD
K
505 44NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
lig 35
GOL
K
2016 6GLYCEROL
lig 36
GOL
K
2018 6GLYCEROL
lig 37
GOL
K
2019 6GLYCEROL
lig 38
NA
L
504 1SODIUM ION
lig 39
NAD
L
505 44NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
lig 40
GOL
L
2000 6GLYCEROL
lig 41
GOL
L
2005 6GLYCEROL
lig 42
GOL
L
2008 6GLYCEROL
lig 43
GOL
L
2015 6GLYCEROL
lig 44
GOL
L
2017 6GLYCEROL