Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3T4U


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 44 ligands in PDB entry 3T4U. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
GOL
A
272 6GLYCEROL
lig 2
SO4
A
273 5SULFATE ION
lig 3
CL
A
274 1CHLORIDE ION
lig 4
GOL
A
275 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
276 6GLYCEROL
lig 6
CL
A
277 1CHLORIDE ION
lig 7
GOL
A
278 6GLYCEROL
lig 8
NA
A
279 1SODIUM ION
lig 9
GOL
B
272 6GLYCEROL
lig 10
GOL
B
273 6GLYCEROL
lig 11
SO4
B
274 5SULFATE ION
lig 12
CL
B
275 1CHLORIDE ION
lig 13
NA
B
276 1SODIUM ION
lig 14
GOL
C
272 6GLYCEROL
lig 15
GOL
C
273 6GLYCEROL
lig 16
SO4
C
274 5SULFATE ION
lig 17
SO4
C
275 5SULFATE ION
lig 18
CL
C
276 1CHLORIDE ION
lig 19
GOL
C
277 6GLYCEROL
lig 20
GOL
C
278 6GLYCEROL
lig 21
GOL
C
279 6GLYCEROL
lig 22
NA
C
280 1SODIUM ION
lig 23
GOL
D
272 6GLYCEROL
lig 24
GOL
D
273 6GLYCEROL
lig 25
SO4
D
274 5SULFATE ION
lig 26
SO4
D
275 5SULFATE ION
lig 27
GOL
D
276 6GLYCEROL
lig 28
CL
D
277 1CHLORIDE ION
lig 29
NA
D
278 1SODIUM ION
lig 30
GOL
E
272 6GLYCEROL
lig 31
GOL
E
273 6GLYCEROL
lig 32
SO4
E
274 5SULFATE ION
lig 33
CL
E
275 1CHLORIDE ION
lig 34
GOL
E
276 6GLYCEROL
lig 35
GOL
E
277 6GLYCEROL
lig 36
GOL
E
278 6GLYCEROL
lig 37
NA
E
279 1SODIUM ION
lig 38
GOL
F
272 6GLYCEROL
lig 39
SO4
F
273 5SULFATE ION
lig 40
SO4
F
274 5SULFATE ION
lig 41
GOL
F
275 6GLYCEROL
lig 42
GOL
F
276 6GLYCEROL
lig 43
GOL
F
277 6GLYCEROL
lig 44
NA
F
278 1SODIUM ION