Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3CDU


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 44 ligands in PDB entry 3CDU. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
CL
A
469 1CHLORIDE ION
lig 2
CL
A
470 1CHLORIDE ION
lig 3
CL
A
471 1CHLORIDE ION
lig 4
CL
A
472 1CHLORIDE ION
lig 5
CL
A
473 1CHLORIDE ION
lig 6
CL
A
474 1CHLORIDE ION
lig 7
SO4
A
475 5SULFATE ION
lig 8
ACT
A
476 4ACETATE ION
lig 9
ACT
A
477 4ACETATE ION
lig 10
ACT
A
478 4ACETATE ION
lig 11
ACT
A
479 4ACETATE ION
lig 12
ACT
A
480 4ACETATE ION
lig 13
ACT
A
481 4ACETATE ION
lig 14
POP
A
482 9PYROPHOSPHATE 2-
lig 15
GOL
A
483 6GLYCEROL
lig 16
GOL
A
484 6GLYCEROL
lig 17
GOL
A
485 6GLYCEROL
lig 18
GOL
A
486 6GLYCEROL
lig 19
GOL
A
487 6GLYCEROL
lig 20
GOL
A
488 6GLYCEROL
lig 21
GOL
A
489 6GLYCEROL
lig 22
GOL
A
490 6GLYCEROL
lig 23
GOL
A
491 6GLYCEROL
lig 24
GOL
A
492 6GLYCEROL
lig 25
GOL
A
493 6GLYCEROL
lig 26
GOL
A
494 6GLYCEROL
lig 27
GOL
A
495 6GLYCEROL
lig 28
GOL
A
496 6GLYCEROL
lig 29
GOL
A
497 6GLYCEROL
lig 30
GOL
A
498 6GLYCEROL
lig 31
GOL
A
499 6GLYCEROL
lig 32
GOL
A
500 6GLYCEROL
lig 33
GOL
A
501 6GLYCEROL
lig 34
GOL
A
502 6GLYCEROL
lig 35
GOL
A
503 6GLYCEROL
lig 36
GOL
A
504 6GLYCEROL
lig 37
GOL
A
505 6GLYCEROL
lig 38
GOL
A
506 6GLYCEROL
lig 39
GOL
A
507 6GLYCEROL
lig 40
GOL
A
508 6GLYCEROL
lig 41
GOL
A
509 6GLYCEROL
lig 42
GOL
A
510 6GLYCEROL
lig 43
GOL
A
511 6GLYCEROL
lig 44
GOL
A
512 6GLYCEROL