Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3CVO


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 50 ligands in PDB entry 3CVO. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
SO4
A
202 5SULFATE ION
lig 2
EDO
A
203 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
204 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
205 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
206 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
207 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
208 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
209 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
210 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
211 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
212 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
SO4
B
202 5SULFATE ION
lig 15
EDO
B
203 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
B
204 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
B
205 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
B
206 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
B
207 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
B
208 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
B
209 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
B
210 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
B
211 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
B
212 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
B
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
B
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
B
215 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
C
202 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
C
203 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
C
204 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
C
205 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
C
206 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
C
207 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
C
208 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
GOL
C
209 6GLYCEROL
lig 36
EDO
D
202 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
D
203 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
D
204 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
D
205 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
D
206 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
D
207 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
D
208 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
D
209 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
D
210 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
D
211 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
D
212 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
D
213 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
D
214 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
D
215 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
PG4
D
216 13TETRAETHYLENE GLYCOL