Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3KD4


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 27 ligands in PDB entry 3KD4. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
PO4
A
2 5PHOSPHATE ION
lig 2
PO4
A
3 5PHOSPHATE ION
lig 3
PO4
A
5 5PHOSPHATE ION
lig 4
GOL
A
7 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
8 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
9 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
10 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
15 6GLYCEROL
lig 9
GOL
A
18 6GLYCEROL
lig 10
GOL
A
19 6GLYCEROL
lig 11
GOL
A
21 6GLYCEROL
lig 12
GOL
A
528 6GLYCEROL
lig 13
GOL
A
529 6GLYCEROL
lig 14
GOL
A
530 6GLYCEROL
lig 15
GOL
A
531 6GLYCEROL
lig 16
PO4
B
1 5PHOSPHATE ION
lig 17
PO4
B
4 5PHOSPHATE ION
lig 18
PO4
B
6 5PHOSPHATE ION
lig 19
GOL
B
11 6GLYCEROL
lig 20
GOL
B
12 6GLYCEROL
lig 21
GOL
B
13 6GLYCEROL
lig 22
GOL
B
14 6GLYCEROL
lig 23
GOL
B
16 6GLYCEROL
lig 24
GOL
B
17 6GLYCEROL
lig 25
GOL
B
20 6GLYCEROL
lig 26
GOL
B
528 6GLYCEROL
lig 27
GOL
B
529 6GLYCEROL