Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3MBO


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 31 ligands in PDB entry 3MBO. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
UDP
A
382 25URIDINE-5'-DIPHOSPHATE
lig 2
GOL
A
383 6GLYCEROL
lig 3
GOL
A
384 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
385 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
386 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
387 6GLYCEROL
lig 7
MLT
A
388 9D-MALATE
lig 8
GOL
B
382 6GLYCEROL
lig 9
GOL
B
383 6GLYCEROL
lig 10
UDP
C
382 25URIDINE-5'-DIPHOSPHATE
lig 11
GOL
C
383 6GLYCEROL
lig 12
GOL
C
384 6GLYCEROL
lig 13
MLT
C
385 9D-MALATE
lig 14
MG
C
386 1MAGNESIUM ION
lig 15
GOL
D
382 6GLYCEROL
lig 16
GOL
D
383 6GLYCEROL
lig 17
GOL
D
384 6GLYCEROL
lig 18
UDP
E
382 25URIDINE-5'-DIPHOSPHATE
lig 19
GOL
E
383 6GLYCEROL
lig 20
GOL
E
384 6GLYCEROL
lig 21
GOL
E
385 6GLYCEROL
lig 22
GOL
E
386 6GLYCEROL
lig 23
MLT
E
387 9D-MALATE
lig 24
MG
E
388 1MAGNESIUM ION
lig 25
GOL
F
382 6GLYCEROL
lig 26
GOL
F
383 6GLYCEROL
lig 27
GOL
F
384 6GLYCEROL
lig 28
GOL
F
385 6GLYCEROL
lig 29
UDP
H
382 25URIDINE-5'-DIPHOSPHATE
lig 30
GOL
H
383 6GLYCEROL
lig 31
MLT
H
384 9D-MALATE