Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
3MI5


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 102 ligands in PDB entry 3MI5. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
SO4
A
201 5SULFATE ION
lig 2
BME
A
202 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 3
GOL
A
203 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
204 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
205 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
206 6GLYCEROL
lig 7
CAQ
A
207 8CATECHOL
lig 8
GOL
A
208 6GLYCEROL
lig 9
FE
M
600 1FE (III) ION
lig 10
GOL
M
12 6GLYCEROL
lig 11
GOL
M
16 6GLYCEROL
lig 12
BME
M
28 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 13
BME
M
30 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 14
GOL
M
10 6GLYCEROL
lig 15
GOL
M
14 6GLYCEROL
lig 16
BME
M
1 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 17
CL
M
2 1CHLORIDE ION
lig 18
CAQ
M
539 8CATECHOL
lig 19
BME
M
540 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 20
SO4
B
201 5SULFATE ION
lig 21
BME
B
202 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 22
GOL
B
203 6GLYCEROL
lig 23
BME
B
204 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 24
GOL
B
205 6GLYCEROL
lig 25
CAQ
B
206 8CATECHOL
lig 26
GOL
B
207 6GLYCEROL
lig 27
FE
N
600 1FE (III) ION
lig 28
SO4
N
11 5SULFATE ION
lig 29
BME
N
18 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 30
GOL
N
26 6GLYCEROL
lig 31
BME
N
8 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 32
GOL
N
1 6GLYCEROL
lig 33
CAQ
N
3 8CATECHOL
lig 34
CL
N
539 1CHLORIDE ION
lig 35
SO4
C
201 5SULFATE ION
lig 36
GOL
C
202 6GLYCEROL
lig 37
GOL
C
203 6GLYCEROL
lig 38
GOL
C
204 6GLYCEROL
lig 39
BME
C
205 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 40
CAQ
C
206 8CATECHOL
lig 41
GOL
C
207 6GLYCEROL
lig 42
FE
O
600 1FE (III) ION
lig 43
SO4
O
12 5SULFATE ION
lig 44
GOL
O
17 6GLYCEROL
lig 45
GOL
O
29 6GLYCEROL
lig 46
BME
O
9 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 47
GOL
O
1 6GLYCEROL
lig 48
GOL
O
539 6GLYCEROL
lig 49
CAQ
O
4 8CATECHOL
lig 50
BME
O
540 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 51
CL
O
541 1CHLORIDE ION
lig 52
BME
O
542 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 53
SO4
D
201 5SULFATE ION
lig 54
BME
D
202 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 55
GOL
D
203 6GLYCEROL
lig 56
GOL
D
204 6GLYCEROL
lig 57
GOL
D
205 6GLYCEROL
lig 58
GOL
D
206 6GLYCEROL
lig 59
BME
D
207 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 60
CAQ
D
208 8CATECHOL
lig 61
FE
P
600 1FE (III) ION
lig 62
BME
P
5 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 63
GOL
P
17 6GLYCEROL
lig 64
GOL
P
1 6GLYCEROL
lig 65
BME
P
539 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 66
GOL
P
540 6GLYCEROL
lig 67
BME
P
541 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 68
SO4
P
2 5SULFATE ION
lig 69
CAQ
P
542 8CATECHOL
lig 70
BME
P
543 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 71
SO4
E
201 5SULFATE ION
lig 72
GOL
E
202 6GLYCEROL
lig 73
GOL
E
203 6GLYCEROL
lig 74
BME
E
204 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 75
GOL
E
205 6GLYCEROL
lig 76
GOL
E
206 6GLYCEROL
lig 77
CAQ
E
207 8CATECHOL
lig 78
BME
E
208 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 79
FE
Q
600 1FE (III) ION
lig 80
SO4
Q
10 5SULFATE ION
lig 81
GOL
Q
15 6GLYCEROL
lig 82
GOL
Q
1 6GLYCEROL
lig 83
SO4
Q
539 5SULFATE ION
lig 84
CAQ
Q
6 8CATECHOL
lig 85
GOL
Q
540 6GLYCEROL
lig 86
CL
Q
541 1CHLORIDE ION
lig 87
SO4
F
201 5SULFATE ION
lig 88
GOL
F
202 6GLYCEROL
lig 89
GOL
F
203 6GLYCEROL
lig 90
GOL
F
204 6GLYCEROL
lig 91
BME
F
205 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 92
CAQ
F
206 8CATECHOL
lig 93
BME
F
207 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 94
FE
R
600 1FE (III) ION
lig 95
GOL
R
15 6GLYCEROL
lig 96
BME
R
21 4BETA-MERCAPTOETHANOL
lig 97
GOL
R
23 6GLYCEROL
lig 98
GOL
R
13 6GLYCEROL
lig 99
SO4
R
3 5SULFATE ION
lig 100
CAQ
R
1 8CATECHOL
lig 101
CL
R
539 1CHLORIDE ION
lig 102
BME
R
540 4BETA-MERCAPTOETHANOL