Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
4XTN


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 148 ligands in PDB entry 4XTN. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
LYR
A
255 29 TETRAENYL]LYSINE
lig 2
LYR
B
255 29 TETRAENYL]LYSINE
lig 3
LYR
C
255 29 TETRAENYL]LYSINE
lig 4
LYR
D
255 29 TETRAENYL]LYSINE
lig 5
LYR
E
255 29 TETRAENYL]LYSINE
lig 6
LYR
F
255 29 TETRAENYL]LYSINE
lig 7
LYR
G
255 29 TETRAENYL]LYSINE
lig 8
LYR
H
255 29 TETRAENYL]LYSINE
lig 9
LYR
I
255 29 TETRAENYL]LYSINE
lig 10
LYR
J
255 29 TETRAENYL]LYSINE
lig 11
NA
A
301 1SODIUM ION
lig 12
LFA
A
302 14EICOSANE
lig 13
LFA
A
303 6EICOSANE
lig 14
LFA
A
304 10EICOSANE
lig 15
LFA
A
305 10EICOSANE
lig 16
LFA
A
306 14EICOSANE
lig 17
LFA
A
307 18EICOSANE
lig 18
LFA
A
308 8EICOSANE
lig 19
LFA
A
309 8EICOSANE
lig 20
LFA
A
310 8EICOSANE
lig 21
LFA
A
311 7EICOSANE
lig 22
LFA
A
312 5EICOSANE
lig 23
MPG
A
313 14[(Z)-OCTADEC-9-ENYL] (2R)-2,3-BIS(OXIDANYL
lig 24
NA
B
301 1SODIUM ION
lig 25
LFA
B
302 7EICOSANE
lig 26
LFA
B
303 7EICOSANE
lig 27
LFA
B
304 14EICOSANE
lig 28
LFA
B
305 6EICOSANE
lig 29
LFA
B
306 8EICOSANE
lig 30
LFA
B
307 16EICOSANE
lig 31
LFA
B
308 18EICOSANE
lig 32
LFA
B
309 13EICOSANE
lig 33
LFA
B
310 11EICOSANE
lig 34
LFA
B
311 8EICOSANE
lig 35
MPG
B
312 14[(Z)-OCTADEC-9-ENYL] (2R)-2,3-BIS(OXIDANYL
lig 36
NA
C
301 1SODIUM ION
lig 37
LFA
C
302 7EICOSANE
lig 38
LFA
C
303 10EICOSANE
lig 39
LFA
C
304 6EICOSANE
lig 40
LFA
C
305 10EICOSANE
lig 41
LFA
C
306 16EICOSANE
lig 42
LFA
C
307 18EICOSANE
lig 43
LFA
C
308 10EICOSANE
lig 44
LFA
C
309 8EICOSANE
lig 45
LFA
C
310 13EICOSANE
lig 46
LFA
C
311 8EICOSANE
lig 47
LFA
C
312 4EICOSANE
lig 48
MPG
C
313 13[(Z)-OCTADEC-9-ENYL] (2R)-2,3-BIS(OXIDANYL
lig 49
NA
D
301 1SODIUM ION
lig 50
LFA
D
302 7EICOSANE
lig 51
LFA
D
303 14EICOSANE
lig 52
LFA
D
304 6EICOSANE
lig 53
LFA
D
305 10EICOSANE
lig 54
LFA
D
306 16EICOSANE
lig 55
LFA
D
307 18EICOSANE
lig 56
LFA
D
308 10EICOSANE
lig 57
LFA
D
309 8EICOSANE
lig 58
LFA
D
310 8EICOSANE
lig 59
LFA
D
311 7EICOSANE
lig 60
LFA
D
312 6EICOSANE
lig 61
LFA
D
313 6EICOSANE
lig 62
LFA
D
314 7EICOSANE
lig 63
MPG
D
315 14[(Z)-OCTADEC-9-ENYL] (2R)-2,3-BIS(OXIDANYL
lig 64
LFA
D
316 5EICOSANE
lig 65
LFA
D
317 5EICOSANE
lig 66
LFA
D
318 5EICOSANE
lig 67
NA
E
301 1SODIUM ION
lig 68
LFA
E
302 14EICOSANE
lig 69
LFA
E
303 18EICOSANE
lig 70
LFA
E
304 8EICOSANE
lig 71
LFA
E
305 6EICOSANE
lig 72
LFA
E
306 12EICOSANE
lig 73
LFA
E
307 8EICOSANE
lig 74
LFA
E
308 14EICOSANE
lig 75
LFA
E
309 6EICOSANE
lig 76
LFA
E
310 10EICOSANE
lig 77
LFA
E
311 8EICOSANE
lig 78
LFA
E
312 8EICOSANE
lig 79
MPG
E
313 14[(Z)-OCTADEC-9-ENYL] (2R)-2,3-BIS(OXIDANYL
lig 80
NA
F
301 1SODIUM ION
lig 81
LFA
F
302 7EICOSANE
lig 82
LFA
F
303 14EICOSANE
lig 83
LFA
F
304 10EICOSANE
lig 84
LFA
F
305 6EICOSANE
lig 85
LFA
F
306 10EICOSANE
lig 86
LFA
F
307 6EICOSANE
lig 87
LFA
F
308 8EICOSANE
lig 88
LFA
F
309 10EICOSANE
lig 89
LFA
F
310 18EICOSANE
lig 90
LFA
F
311 10EICOSANE
lig 91
LFA
F
312 8EICOSANE
lig 92
LFA
F
313 14EICOSANE
lig 93
LFA
F
314 8EICOSANE
lig 94
MPG
F
315 14[(Z)-OCTADEC-9-ENYL] (2R)-2,3-BIS(OXIDANYL
lig 95
NA
G
301 1SODIUM ION
lig 96
LFA
G
302 16EICOSANE
lig 97
LFA
G
303 7EICOSANE
lig 98
LFA
G
304 14EICOSANE
lig 99
LFA
G
305 6EICOSANE
lig 100
LFA
G
306 10EICOSANE
lig 101
LFA
G
307 16EICOSANE
lig 102
LFA
G
308 18EICOSANE
lig 103
LFA
G
309 8EICOSANE
lig 104
LFA
G
310 10EICOSANE
lig 105
LFA
G
311 8EICOSANE
lig 106
MPG
G
312 14[(Z)-OCTADEC-9-ENYL] (2R)-2,3-BIS(OXIDANYL
lig 107
LFA
G
313 8EICOSANE
lig 108
LFA
G
314 6EICOSANE
lig 109
LFA
G
315 6EICOSANE
lig 110
NA
H
301 1SODIUM ION
lig 111
LFA
H
302 13EICOSANE
lig 112
LFA
H
303 6EICOSANE
lig 113
LFA
H
304 10EICOSANE
lig 114
LFA
H
305 16EICOSANE
lig 115
LFA
H
306 18EICOSANE
lig 116
LFA
H
307 14EICOSANE
lig 117
LFA
H
308 8EICOSANE
lig 118
LFA
H
309 5EICOSANE
lig 119
LFA
H
310 8EICOSANE
lig 120
LFA
H
311 7EICOSANE
lig 121
LFA
H
312 6EICOSANE
lig 122
MPG
H
313 14[(Z)-OCTADEC-9-ENYL] (2R)-2,3-BIS(OXIDANYL
lig 123
NA
I
301 1SODIUM ION
lig 124
LFA
I
302 7EICOSANE
lig 125
LFA
I
303 7EICOSANE
lig 126
LFA
I
304 14EICOSANE
lig 127
LFA
I
305 6EICOSANE
lig 128
LFA
I
306 10EICOSANE
lig 129
LFA
I
307 6EICOSANE
lig 130
LFA
I
308 16EICOSANE
lig 131
LFA
I
309 18EICOSANE
lig 132
LFA
I
310 14EICOSANE
lig 133
LFA
I
311 8EICOSANE
lig 134
LFA
I
312 7EICOSANE
lig 135
LFA
I
313 4EICOSANE
lig 136
MPG
I
314 14[(Z)-OCTADEC-9-ENYL] (2R)-2,3-BIS(OXIDANYL
lig 137
NA
J
301 1SODIUM ION
lig 138
LFA
J
302 16EICOSANE
lig 139
LFA
J
303 18EICOSANE
lig 140
LFA
J
304 8EICOSANE
lig 141
LFA
J
305 14EICOSANE
lig 142
LFA
J
306 8EICOSANE
lig 143
LFA
J
307 7EICOSANE
lig 144
LFA
J
308 14EICOSANE
lig 145
LFA
J
309 10EICOSANE
lig 146
LFA
J
310 10EICOSANE
lig 147
LFA
J
311 4EICOSANE
lig 148
MPG
J
312 14[(Z)-OCTADEC-9-ENYL] (2R)-2,3-BIS(OXIDANYL