Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
4KTR


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 74 ligands in PDB entry 4KTR. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
IFM
A
801 105-HYDROXYMETHYL-3,4-DIHYDROXYPIPERIDINE
lig 2
1PE
A
802 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 3
GOL
A
803 6GLYCEROL
lig 4
GOL
A
804 6GLYCEROL
lig 5
GOL
A
805 6GLYCEROL
lig 6
P6G
A
806 19HEXAETHYLENE GLYCOL
lig 7
GOL
A
807 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
808 6GLYCEROL
lig 9
GOL
A
809 6GLYCEROL
lig 10
GOL
A
810 6GLYCEROL
lig 11
GOL
A
811 6GLYCEROL
lig 12
PGE
A
812 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 13
CA
A
813 1CALCIUM ION
lig 14
PG4
B
801 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 15
7PE
B
802 21 ETHOXY)ETHANOL
lig 16
GOL
B
803 6GLYCEROL
lig 17
GOL
B
804 6GLYCEROL
lig 18
GOL
B
805 6GLYCEROL
lig 19
GOL
B
806 6GLYCEROL
lig 20
GOL
B
807 6GLYCEROL
lig 21
GOL
B
808 6GLYCEROL
lig 22
CA
B
809 1CALCIUM ION
lig 23
1PE
C
801 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 24
GOL
C
802 6GLYCEROL
lig 25
GOL
C
803 6GLYCEROL
lig 26
GOL
C
804 6GLYCEROL
lig 27
PE4
C
805 24 ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL
lig 28
GOL
C
806 6GLYCEROL
lig 29
PGE
C
807 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 30
GOL
C
808 6GLYCEROL
lig 31
GOL
C
809 6GLYCEROL
lig 32
CA
C
810 1CALCIUM ION
lig 33
IFM
D
801 105-HYDROXYMETHYL-3,4-DIHYDROXYPIPERIDINE
lig 34
GOL
D
802 6GLYCEROL
lig 35
PG4
D
803 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 36
GOL
D
804 6GLYCEROL
lig 37
GOL
D
805 6GLYCEROL
lig 38
GOL
D
806 6GLYCEROL
lig 39
GOL
D
807 6GLYCEROL
lig 40
7PE
D
808 21 ETHOXY)ETHANOL
lig 41
GOL
D
809 6GLYCEROL
lig 42
GOL
D
810 6GLYCEROL
lig 43
GOL
D
811 6GLYCEROL
lig 44
GOL
D
812 6GLYCEROL
lig 45
CA
D
813 1CALCIUM ION
lig 46
CA
D
814 1CALCIUM ION
lig 47
IFM
E
801 105-HYDROXYMETHYL-3,4-DIHYDROXYPIPERIDINE
lig 48
1PE
E
802 16PENTAETHYLENE GLYCOL
lig 49
P6G
E
803 19HEXAETHYLENE GLYCOL
lig 50
GOL
E
804 6GLYCEROL
lig 51
GOL
E
805 6GLYCEROL
lig 52
GOL
E
806 6GLYCEROL
lig 53
GOL
E
807 6GLYCEROL
lig 54
CA
E
808 1CALCIUM ION
lig 55
IFM
F
801 105-HYDROXYMETHYL-3,4-DIHYDROXYPIPERIDINE
lig 56
GOL
F
802 6GLYCEROL
lig 57
PG4
F
803 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 58
GOL
F
804 6GLYCEROL
lig 59
GOL
F
805 6GLYCEROL
lig 60
PGE
F
806 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 61
IFM
G
801 105-HYDROXYMETHYL-3,4-DIHYDROXYPIPERIDINE
lig 62
GOL
G
802 6GLYCEROL
lig 63
GOL
G
803 6GLYCEROL
lig 64
GOL
G
804 6GLYCEROL
lig 65
PGE
G
805 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 66
CA
G
806 1CALCIUM ION
lig 67
IFM
H
801 105-HYDROXYMETHYL-3,4-DIHYDROXYPIPERIDINE
lig 68
GOL
H
802 6GLYCEROL
lig 69
PG4
H
803 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 70
GOL
H
804 6GLYCEROL
lig 71
GOL
H
805 6GLYCEROL
lig 72
GOL
H
806 6GLYCEROL
lig 73
GOL
H
807 6GLYCEROL
lig 74
PE5
H
808 273,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL