Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
5NQA


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 83 ligands in PDB entry 5NQA. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
EDO
A
601 41,2-ETHANEDIOL
lig 2
EDO
A
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
606 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
607 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
608 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
609 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
610 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
611 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
612 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
613 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
614 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
615 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
616 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
617 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
618 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
619 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
620 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
621 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
A
622 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
A
623 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
624 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
A
625 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
A
626 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
A
627 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
A
628 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
A
629 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
A
630 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
A
631 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
A
632 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
A
633 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
A
634 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
A
635 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
A
636 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
A
637 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
GOL
A
638 6GLYCEROL
lig 39
GOL
A
639 6GLYCEROL
lig 40
GOL
A
640 6GLYCEROL
lig 41
GOL
A
641 6GLYCEROL
lig 42
GOL
A
642 6GLYCEROL
lig 43
GOL
A
643 6GLYCEROL
lig 44
NGA
A
644 152-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GALACTOPYRANOSE
lig 45
EDO
B
601 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
B
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
B
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
B
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
B
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
B
606 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
B
607 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
B
608 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
B
609 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
B
610 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
EDO
B
611 41,2-ETHANEDIOL
lig 56
EDO
B
612 41,2-ETHANEDIOL
lig 57
EDO
B
613 41,2-ETHANEDIOL
lig 58
EDO
B
614 41,2-ETHANEDIOL
lig 59
EDO
B
615 41,2-ETHANEDIOL
lig 60
EDO
B
616 41,2-ETHANEDIOL
lig 61
EDO
B
617 41,2-ETHANEDIOL
lig 62
EDO
B
618 41,2-ETHANEDIOL
lig 63
EDO
B
619 41,2-ETHANEDIOL
lig 64
EDO
B
620 41,2-ETHANEDIOL
lig 65
EDO
B
621 41,2-ETHANEDIOL
lig 66
EDO
B
622 41,2-ETHANEDIOL
lig 67
EDO
B
623 41,2-ETHANEDIOL
lig 68
EDO
B
624 41,2-ETHANEDIOL
lig 69
EDO
B
625 41,2-ETHANEDIOL
lig 70
EDO
B
626 41,2-ETHANEDIOL
lig 71
EDO
B
627 41,2-ETHANEDIOL
lig 72
EDO
B
628 41,2-ETHANEDIOL
lig 73
EDO
B
629 41,2-ETHANEDIOL
lig 74
EDO
B
630 41,2-ETHANEDIOL
lig 75
EDO
B
631 41,2-ETHANEDIOL
lig 76
EDO
B
632 41,2-ETHANEDIOL
lig 77
EDO
B
633 41,2-ETHANEDIOL
lig 78
EDO
B
634 41,2-ETHANEDIOL
lig 79
GOL
B
635 6GLYCEROL
lig 80
GOL
B
636 6GLYCEROL
lig 81
GOL
B
637 6GLYCEROL
lig 82
GOL
B
638 6GLYCEROL
lig 83
NGA
G
101 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GALACTOPYRANOSE