Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
5BPK


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 45 ligands in PDB entry 5BPK. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
EDO
A
401 41,2-ETHANEDIOL
lig 2
EDO
A
402 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
403 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
404 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
405 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
406 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
407 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
408 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
409 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
410 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
4UD
C
701 10(2S)-AMINO[(5S)-4,5-DIHYDRO-1,2-OXAZOL-5-Y
lig 12
EDO
C
702 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
C
703 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
C
704 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
C
705 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
C
706 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
C
707 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
C
708 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
C
709 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
C
710 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
C
711 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
B
401 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
B
402 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
B
403 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
B
404 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
B
405 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
B
406 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
B
407 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
B
408 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
B
409 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
B
410 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
B
411 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
B
412 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
B
413 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
4UD
D
701 10(2S)-AMINO[(5S)-4,5-DIHYDRO-1,2-OXAZOL-5-Y
lig 36
EDO
D
702 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
D
703 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
D
704 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
D
705 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
D
706 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
D
707 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
D
708 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
D
709 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
D
710 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
D
711 41,2-ETHANEDIOL