Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
5D4H


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 33 ligands in PDB entry 5D4H. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
CU
A
501 1COPPER (II) ION
lig 2
CU
A
502 1COPPER (II) ION
lig 3
NO2
A
503 3NITRITE ION
lig 4
NO2
A
504 3NITRITE ION
lig 5
GOL
A
505 6GLYCEROL
lig 6
GOL
A
506 6GLYCEROL
lig 7
GOL
A
507 6GLYCEROL
lig 8
GOL
A
508 6GLYCEROL
lig 9
GOL
A
509 6GLYCEROL
lig 10
GOL
A
510 6GLYCEROL
lig 11
GOL
A
511 6GLYCEROL
lig 12
GOL
A
512 6GLYCEROL
lig 13
GOL
A
513 6GLYCEROL
lig 14
GOL
A
514 6GLYCEROL
lig 15
GOL
A
515 6GLYCEROL
lig 16
ACY
A
516 4ACETIC ACID
lig 17
CU
B
501 1COPPER (II) ION
lig 18
CU
B
502 1COPPER (II) ION
lig 19
NO2
B
503 3NITRITE ION
lig 20
GOL
B
504 6GLYCEROL
lig 21
GOL
B
505 6GLYCEROL
lig 22
GOL
B
506 6GLYCEROL
lig 23
GOL
B
507 6GLYCEROL
lig 24
ACY
B
508 4ACETIC ACID
lig 25
CU
C
501 1COPPER (II) ION
lig 26
CU
C
502 1COPPER (II) ION
lig 27
GOL
C
503 6GLYCEROL
lig 28
GOL
C
504 6GLYCEROL
lig 29
GOL
C
505 6GLYCEROL
lig 30
GOL
C
506 6GLYCEROL
lig 31
GOL
C
507 6GLYCEROL
lig 32
GOL
C
508 6GLYCEROL
lig 33
GOL
C
509 6GLYCEROL