Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
5DA8


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 46 ligands in PDB entry 5DA8. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
SO4
A
601 5SULFATE ION
lig 2
CA
A
602 1CALCIUM ION
lig 3
SO4
B
601 5SULFATE ION
lig 4
CA
B
602 1CALCIUM ION
lig 5
SO4
C
601 5SULFATE ION
lig 6
SO4
D
601 5SULFATE ION
lig 7
SO4
E
601 5SULFATE ION
lig 8
SO4
F
601 5SULFATE ION
lig 9
CA
F
602 1CALCIUM ION
lig 10
SO4
G
601 5SULFATE ION
lig 11
CA
G
602 1CALCIUM ION
lig 12
MG
H
601 1MAGNESIUM ION
lig 13
CA
I
601 1CALCIUM ION
lig 14
SO4
J
601 5SULFATE ION
lig 15
CA
J
602 1CALCIUM ION
lig 16
SO4
K
601 5SULFATE ION
lig 17
CA
K
602 1CALCIUM ION
lig 18
SO4
L
601 5SULFATE ION
lig 19
MG
M
601 1MAGNESIUM ION
lig 20
SO4
M
602 5SULFATE ION
lig 21
CA
M
603 1CALCIUM ION
lig 22
SO4
N
601 5SULFATE ION
lig 23
CA
O
601 1CALCIUM ION
lig 24
SO4
P
601 5SULFATE ION
lig 25
CA
P
602 1CALCIUM ION
lig 26
MG
Q
601 1MAGNESIUM ION
lig 27
CA
Q
602 1CALCIUM ION
lig 28
MG
R
601 1MAGNESIUM ION
lig 29
SO4
R
602 5SULFATE ION
lig 30
CA
R
603 1CALCIUM ION
lig 31
MG
S
601 1MAGNESIUM ION
lig 32
MG
T
601 1MAGNESIUM ION
lig 33
SO4
T
602 5SULFATE ION
lig 34
CA
T
603 1CALCIUM ION
lig 35
SO4
U
601 5SULFATE ION
lig 36
CA
U
602 1CALCIUM ION
lig 37
MG
V
601 1MAGNESIUM ION
lig 38
SO4
V
602 5SULFATE ION
lig 39
CA
V
603 1CALCIUM ION
lig 40
SO4
Y
601 5SULFATE ION
lig 41
CA
Y
602 1CALCIUM ION
lig 42
SO4
Z
601 5SULFATE ION
lig 43
CA
Z
602 1CALCIUM ION
lig 44
SO4
a
601 5SULFATE ION
lig 45
CA
a
602 1CALCIUM ION
lig 46
SO4
b
601 5SULFATE ION