Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
5HUD


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 119 ligands in PDB entry 5HUD. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID		Chain
ID		 Residue
N		Number
of atoms 		Ligand name
lig 1
GOL
A
501 6GLYCEROL
lig 2
GOL
A
502 6GLYCEROL
lig 3
PEG
A
503 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 4
PEG
A
504 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 5
PGE
A
505 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 6
MN
A
506 1MANGANESE (II) ION
lig 7
PO4
A
507 5PHOSPHATE ION
lig 8
PO4
A
508 5PHOSPHATE ION
lig 9
TRP
A
509 15TRYPTOPHAN
lig 10
GOL
B
501 6GLYCEROL
lig 11
GOL
B
502 6GLYCEROL
lig 12
GOL
B
503 6GLYCEROL
lig 13
GOL
B
504 6GLYCEROL
lig 14
GOL
B
505 6GLYCEROL
lig 15
GOL
B
506 6GLYCEROL
lig 16
GOL
B
507 6GLYCEROL
lig 17
GOL
B
508 6GLYCEROL
lig 18
GOL
B
509 6GLYCEROL
lig 19
GOL
B
510 6GLYCEROL
lig 20
PEG
B
511 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 21
PG4
B
512 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 22
MN
B
513 1MANGANESE (II) ION
lig 23
PO4
B
514 5PHOSPHATE ION
lig 24
TRP
B
515 15TRYPTOPHAN
lig 25
GOL
C
501 6GLYCEROL
lig 26
GOL
C
502 6GLYCEROL
lig 27
GOL
C
503 6GLYCEROL
lig 28
GOL
C
504 6GLYCEROL
lig 29
GOL
C
505 6GLYCEROL
lig 30
GOL
C
506 6GLYCEROL
lig 31
GOL
C
507 6GLYCEROL
lig 32
GOL
C
508 6GLYCEROL
lig 33
GOL
C
509 6GLYCEROL
lig 34
GOL
C
510 6GLYCEROL
lig 35
GOL
C
511 6GLYCEROL
lig 36
GOL
C
512 6GLYCEROL
lig 37
GOL
C
513 6GLYCEROL
lig 38
GOL
C
514 6GLYCEROL
lig 39
GOL
C
515 6GLYCEROL
lig 40
GOL
C
516 6GLYCEROL
lig 41
GOL
C
517 6GLYCEROL
lig 42
GOL
C
518 6GLYCEROL
lig 43
GOL
C
519 6GLYCEROL
lig 44
GOL
C
520 6GLYCEROL
lig 45
PEG
C
521 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 46
PEG
C
522 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 47
PEG
C
523 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 48
PGE
C
524 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 49
PGE
C
525 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 50
PGE
C
526 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 51
PGE
C
527 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 52
PGE
C
528 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 53
PG4
C
529 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 54
MN
C
530 1MANGANESE (II) ION
lig 55
PO4
C
531 5PHOSPHATE ION
lig 56
TRP
C
532 15TRYPTOPHAN
lig 57
GOL
D
501 6GLYCEROL
lig 58
GOL
D
502 6GLYCEROL
lig 59
GOL
D
503 6GLYCEROL
lig 60
GOL
D
504 6GLYCEROL
lig 61
GOL
D
505 6GLYCEROL
lig 62
GOL
D
506 6GLYCEROL
lig 63
GOL
D
507 6GLYCEROL
lig 64
GOL
D
508 6GLYCEROL
lig 65
GOL
D
509 6GLYCEROL
lig 66
GOL
D
510 6GLYCEROL
lig 67
GOL
D
511 6GLYCEROL
lig 68
GOL
D
512 6GLYCEROL
lig 69
GOL
D
513 6GLYCEROL
lig 70
PEG
D
514 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 71
PEG
D
515 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 72
PEG
D
516 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 73
PEG
D
517 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 74
PEG
D
518 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 75
PEG
D
519 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 76
PGE
D
520 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 77
PGE
D
521 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 78
PG4
D
522 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 79
PG4
D
523 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 80
PG4
D
524 13TETRAETHYLENE GLYCOL
lig 81
MN
D
525 1MANGANESE (II) ION
lig 82
PO4
D
526 5PHOSPHATE ION
lig 83
PO4
D
527 5PHOSPHATE ION
lig 84
TRP
D
528 15TRYPTOPHAN
lig 85
GOL
E
101 6GLYCEROL
lig 86
GOL
E
102 6GLYCEROL
lig 87
GOL
E
103 6GLYCEROL
lig 88
GOL
E
104 6GLYCEROL
lig 89
PGE
E
105 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 90
PGE
E
106 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 91
PGE
E
107 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 92
TSA
E
108 16 DICARBOXYLIC ACID
lig 93
GOL
F
101 6GLYCEROL
lig 94
GOL
F
102 6GLYCEROL
lig 95
GOL
F
103 6GLYCEROL
lig 96
GOL
F
104 6GLYCEROL
lig 97
GOL
F
105 6GLYCEROL
lig 98
GOL
F
106 6GLYCEROL
lig 99
PEG
F
107 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 100
PGE
F
108 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 101
PGE
F
109 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 102
TSA
F
110 16 DICARBOXYLIC ACID
lig 103
GOL
G
101 6GLYCEROL
lig 104
GOL
G
102 6GLYCEROL
lig 105
GOL
G
103 6GLYCEROL
lig 106
GOL
G
104 6GLYCEROL
lig 107
GOL
G
105 6GLYCEROL
lig 108
GOL
G
106 6GLYCEROL
lig 109
PEG
G
107 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 110
PEG
G
108 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 111
PEG
G
109 7DI(HYDROXYETHYL)ETHER
lig 112
PGE
G
110 10TRIETHYLENE GLYCOL
lig 113
TSA
G
111 16 DICARBOXYLIC ACID
lig 114
GOL
H
101 6GLYCEROL
lig 115
GOL
H
102 6GLYCEROL
lig 116
GOL
H
103 6GLYCEROL
lig 117
GOL
H
104 6GLYCEROL
lig 118
GOL
H
105 6GLYCEROL
lig 119
TSA
H
106 16 DICARBOXYLIC ACID