Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
5JAW


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 34 ligands in PDB entry 5JAW. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
UUU
A
601 12 CYCLOHEXANE-1,2,3,4-TETROL
lig 2
NA
A
602 1SODIUM ION
lig 3
NA
A
603 1SODIUM ION
lig 4
NA
A
604 1SODIUM ION
lig 5
UUU
B
601 12 CYCLOHEXANE-1,2,3,4-TETROL
lig 6
NA
B
602 1SODIUM ION
lig 7
NA
B
603 1SODIUM ION
lig 8
NA
B
604 1SODIUM ION
lig 9
UUU
C
601 12 CYCLOHEXANE-1,2,3,4-TETROL
lig 10
NA
C
602 1SODIUM ION
lig 11
NA
C
603 1SODIUM ION
lig 12
NA
C
604 1SODIUM ION
lig 13
NA
C
605 1SODIUM ION
lig 14
UUU
D
601 12 CYCLOHEXANE-1,2,3,4-TETROL
lig 15
NA
D
602 1SODIUM ION
lig 16
NA
D
603 1SODIUM ION
lig 17
NA
D
604 1SODIUM ION
lig 18
UUU
E
601 12 CYCLOHEXANE-1,2,3,4-TETROL
lig 19
NA
E
602 1SODIUM ION
lig 20
NA
E
603 1SODIUM ION
lig 21
NA
E
604 1SODIUM ION
lig 22
NA
E
605 1SODIUM ION
lig 23
NA
E
606 1SODIUM ION
lig 24
ACT
E
607 4ACETATE ION
lig 25
UUU
F
601 12 CYCLOHEXANE-1,2,3,4-TETROL
lig 26
NA
F
602 1SODIUM ION
lig 27
NA
F
603 1SODIUM ION
lig 28
UUU
G
601 12 CYCLOHEXANE-1,2,3,4-TETROL
lig 29
NA
G
602 1SODIUM ION
lig 30
NA
G
603 1SODIUM ION
lig 31
NA
G
604 1SODIUM ION
lig 32
UUU
H
601 12 CYCLOHEXANE-1,2,3,4-TETROL
lig 33
NA
H
602 1SODIUM ION
lig 34
NA
H
603 1SODIUM ION