Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
5KDW


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 51 ligands in PDB entry 5KDW. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
EDO
A
1001 41,2-ETHANEDIOL
lig 2
EDO
A
1002 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
1003 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
1004 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
A
1005 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
A
1006 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
1007 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
1008 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
1009 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
1010 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
1011 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
1012 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
1013 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
1014 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
1015 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
1016 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
1017 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
1018 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
1019 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
1020 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
1021 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
ZN
A
1022 1ZINC ION
lig 23
PO4
A
1023 5PHOSPHATE ION
lig 24
PO4
A
1024 5PHOSPHATE ION
lig 25
PO4
A
1025 5PHOSPHATE ION
lig 26
PO4
A
1026 5PHOSPHATE ION
lig 27
EDO
B
1001 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
B
1002 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
B
1003 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
EDO
B
1004 41,2-ETHANEDIOL
lig 31
EDO
B
1005 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
B
1006 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
B
1007 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
B
1008 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
B
1009 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
B
1010 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
B
1011 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
B
1012 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
B
1013 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
B
1014 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
B
1015 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
B
1016 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
B
1017 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
B
1018 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
B
1019 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
B
1020 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
B
1021 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
ZN
B
1022 1ZINC ION
lig 49
PO4
B
1023 5PHOSPHATE ION
lig 50
PO4
B
1024 5PHOSPHATE ION
lig 51
PO4
B
1025 5PHOSPHATE ION