Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
5OAJ


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 51 ligands in PDB entry 5OAJ. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
NAG
A
301 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 2
EDO
A
302 41,2-ETHANEDIOL
lig 3
EDO
A
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 4
EDO
A
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 5
EDO
B
601 41,2-ETHANEDIOL
lig 6
EDO
B
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
B
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
B
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
B
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
FLC
C
601 13CITRATE ANION
lig 11
EDO
C
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
C
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
C
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
C
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
D
301 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
D
302 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
D
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
D
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
TKT
E
601 21 INDOLE-3-CARBOXYLATE
lig 20
EDO
E
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
NAG
E
603 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 22
EDO
E
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
E
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
E
606 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
F
601 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
EDO
F
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 27
EDO
F
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 28
EDO
F
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 29
EDO
F
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 30
FLC
G
601 13CITRATE ANION
lig 31
EDO
G
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 32
EDO
G
603 41,2-ETHANEDIOL
lig 33
EDO
G
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
G
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
NAG
H
301 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 36
EDO
H
302 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
H
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
H
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
H
305 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
FLC
I
601 13CITRATE ANION
lig 41
EDO
I
602 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
NAG
I
603 142-ACETAMIDO-2-DEOXY-BETA-D-GLUCOPYRANOSE
lig 43
EDO
I
604 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
I
605 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
I
606 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
J
301 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
TKT
J
302 21 INDOLE-3-CARBOXYLATE
lig 48
EDO
J
303 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
J
304 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
J
305 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
J
306 41,2-ETHANEDIOL