Analysis of Ligand-Protein Contacts in PDB entry:
5TA5


Ligand-Protein Contacts (LPC) are derived with the LPC software (Sobolev V., Sorokine A., Prilusky J., Abola E.E. and Edelman M. (1999) Automated analysis of interatomic contacts in proteins. Bioinformatics, 15, 327-332).

There are 57 ligands in PDB entry 5TA5. Click on ligand of interest for LPC analysis.


HET
ID
Chain
ID
Residue
N
Number
of atoms
Ligand name
lig 1
GAL
C
1 12BETA-D-GALACTOPYRANOSE
lig 2
AAL
C
2 103,6-ANHYDRO-ALPHA-L-GALACTOPYRANOSE
lig 3
AAL
D
1 113,6-ANHYDRO-ALPHA-L-GALACTOPYRANOSE
lig 4
GAL
D
2 11BETA-D-GALACTOPYRANOSE
lig 5
SO4
A
705 5SULFATE ION
lig 6
EDO
A
706 41,2-ETHANEDIOL
lig 7
EDO
A
707 41,2-ETHANEDIOL
lig 8
EDO
A
708 41,2-ETHANEDIOL
lig 9
EDO
A
709 41,2-ETHANEDIOL
lig 10
EDO
A
710 41,2-ETHANEDIOL
lig 11
EDO
A
711 41,2-ETHANEDIOL
lig 12
EDO
A
712 41,2-ETHANEDIOL
lig 13
EDO
A
713 41,2-ETHANEDIOL
lig 14
EDO
A
714 41,2-ETHANEDIOL
lig 15
EDO
A
715 41,2-ETHANEDIOL
lig 16
EDO
A
716 41,2-ETHANEDIOL
lig 17
EDO
A
717 41,2-ETHANEDIOL
lig 18
EDO
A
718 41,2-ETHANEDIOL
lig 19
EDO
A
719 41,2-ETHANEDIOL
lig 20
EDO
A
720 41,2-ETHANEDIOL
lig 21
EDO
A
721 41,2-ETHANEDIOL
lig 22
EDO
A
722 41,2-ETHANEDIOL
lig 23
EDO
A
723 41,2-ETHANEDIOL
lig 24
EDO
A
724 41,2-ETHANEDIOL
lig 25
EDO
A
725 41,2-ETHANEDIOL
lig 26
CA
A
726 1CALCIUM ION
lig 27
CA
A
727 1CALCIUM ION
lig 28
CA
A
728 1CALCIUM ION
lig 29
SO4
B
701 5SULFATE ION
lig 30
SO4
B
702 5SULFATE ION
lig 31
SO4
B
703 5SULFATE ION
lig 32
SO4
B
704 5SULFATE ION
lig 33
EDO
B
705 41,2-ETHANEDIOL
lig 34
EDO
B
706 41,2-ETHANEDIOL
lig 35
EDO
B
707 41,2-ETHANEDIOL
lig 36
EDO
B
708 41,2-ETHANEDIOL
lig 37
EDO
B
709 41,2-ETHANEDIOL
lig 38
EDO
B
710 41,2-ETHANEDIOL
lig 39
EDO
B
711 41,2-ETHANEDIOL
lig 40
EDO
B
712 41,2-ETHANEDIOL
lig 41
EDO
B
713 41,2-ETHANEDIOL
lig 42
EDO
B
714 41,2-ETHANEDIOL
lig 43
EDO
B
715 41,2-ETHANEDIOL
lig 44
EDO
B
716 41,2-ETHANEDIOL
lig 45
EDO
B
717 41,2-ETHANEDIOL
lig 46
EDO
B
718 41,2-ETHANEDIOL
lig 47
EDO
B
719 41,2-ETHANEDIOL
lig 48
EDO
B
720 41,2-ETHANEDIOL
lig 49
EDO
B
721 41,2-ETHANEDIOL
lig 50
EDO
B
722 41,2-ETHANEDIOL
lig 51
EDO
B
723 41,2-ETHANEDIOL
lig 52
EDO
B
724 41,2-ETHANEDIOL
lig 53
EDO
B
725 41,2-ETHANEDIOL
lig 54
EDO
B
726 41,2-ETHANEDIOL
lig 55
CA
B
727 1CALCIUM ION
lig 56
CA
B
728 1CALCIUM ION
lig 57
CA
B
729 1CALCIUM ION